RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	KIN4	Q01919	800 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUP49	Q02199	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ECM23	Q02710	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ODC1	Q03028	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DUS4	Q06063	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PEX27	Q08580	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NMD4	Q12129	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YLR462W	O13556	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CBP1	P07252	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MDL2	P33311	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TGL1	P34163	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPT53	P36019	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GMH1	P36125	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VBA5	P36172	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MBA1	P38300	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YHL049C	P38722	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YEL075C	P39972	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YER189W	P40104	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YFL064C	P43540	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGR117C	P53270	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDR366C	P87287	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DYN2	Q02647	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SMA1	Q02651	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NAT4	Q04751	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	EST2	Q06163	884 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TGL5	Q12043	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SPE4	Q12455	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SKS1	Q12505	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TMA17	Q12513	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FLP1	P03870	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	APE1	P14904	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRM1	P21827	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VBA3	P25594	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
EXO1	YOR033C	COS9	P36034	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YBL086C	P38177	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FAD1	P38913	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FET3	P38993	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YER085C	P40058	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FLC3	P53121	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YNL184C	P53876	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YML096W	Q04489	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TPO4	Q12256	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FRE6	Q12473	712 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PRM4	Q12498	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RIB3	Q99258	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ARE1	P25628	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ADE1	P27616	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	COT1	P32798	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VRP1	P37370	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YBR284W	P38150	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YJR120W	P47157	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MCM22	P47167	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TIM21	P53220	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SHH3	Q04487	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ENV7	Q12003	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TFC7	Q12415	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FRT1	Q99332	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CDC6	P09119	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NAM2	P11325	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HAP4	P14064	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CBS1	P14066	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUP1	P20676	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RBK1	P25332	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BUB3	P26449	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PHO91	P27514	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	UBC8	P28263	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TUL1	P36096	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RIB5	P38145	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ARN2	P38724	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GEP4	P38812	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BDH1	P39714	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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