RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	SWC5	P38326	303 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	KEG1	P43614	200 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	BIR1	P47134	954 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	CAB5	Q03941	241 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	BUR2	Q05949	395 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	CUR1	Q06469	252 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	FDH1	Q08911	376 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	HIF1	Q12373	385 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL035C	YNL035C	PET18	P25362	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	FUN26	P31381	517 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YPS1	P32329	569 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RBG1	P39729	369 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YMR134W	P40207	237 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CIN2	P46670	268 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	BNS1	P50084	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	NAS6	P50086	228 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CRH1	P53301	507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	DAL5	P15365	543 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	MKK1	P32490	508 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	MRPL40	P36534	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CLD1	P53264	445 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	SHY1	P53266	389 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CSM3	Q04659	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	MSC3	Q05812	728 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	JID1	Q12350	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	APC2	Q12440	853 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPB5	P20434	215 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	DAL80	P26343	269 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	BUD2	P33314	1104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PEX32	P38292	413 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	HEM14	P40012	539 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YCH1	P42937	148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	ATG18	P43601	500 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	HRT3	Q12347	344 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	UBA3	Q99344	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	OXA1	P39952	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YGR168C	P53293	376 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	ARP5	P53946	755 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	VTI1	Q04338	217 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PLP2	Q12017	286 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	HEM4	P06174	275 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	GAL7	P08431	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	MIG3	P39943	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YGL242C	P53066	181 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PUT4	P15380	627 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PRR1	P28708	518 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	ERG9	P29704	444 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	HXT1	P32465	570 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	PPQ1	P32945	549 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	YKR015C	P36111	568 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	FET3	P38993	636 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	TAF6	P53040	516 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	VOA1	P53262	265 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL035C	YNL035C	LIP2	Q06005	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms