RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	TOM22	P49334	152 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SNF12	P53628	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YNL181W	P53878	407 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	IGO1	P53897	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SMA1	Q02651	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GRX5	Q02784	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SWP1	Q02795	286 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TLG1	Q03322	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GLE1	Q12315	538 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RIB3	Q99258	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RHB1	P25378	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SSO1	P32867	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YHR033W	P38690	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	KRE29	P40026	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YNL195C	P40168	261 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	APQ12	P40532	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SSU1	P41930	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YJL043W	P47053	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TIM10	P87108	93 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RRN5	Q02983	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SPO77	Q06134	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TEN1	Q07921	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	PLB3	Q08108	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	PFA4	Q12006	378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SUL2	Q12325	893 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	HSP42	Q12329	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	IES3	Q12345	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MED11	Q99278	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	RPN13	O13563	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MER1	P16523	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MDM10	P18409	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	YCL049C	P25577	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	PET127	P32606	800 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	RML2	P32611	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	RRN10	P38204	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MTG2	P38860	518 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	CCT6	P39079	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	AIM2	P39721	246 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	SOK1	P40317	901 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MAD2	P40958	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	PRM10	P42946	383 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	IRC5	P43610	853 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	PRM8	P53174	237 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	FMP42	Q04991	504 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	COQ11	Q05892	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	REX4	Q08237	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	DCI1	Q08558	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MSH5	Q12175	901 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	PUT2	P07275	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	CLB2	P24869	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	YIM1	P28625	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	ITR2	P30606	609 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	NPL6	P32832	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	ORC2	P32833	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	SEC66	P33754	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	TPO5	P36029	618 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	MNN2	P38069	597 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LOH1	YJL038C	YBR139W	P38109	508 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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