RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	YGR111W	P53265	400 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	URH1	Q04179	340 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SMA2	Q04658	369 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SML1	Q04964	104 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ECM7	Q06200	448 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CUR1	Q06469	252 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SRL2	Q12020	392 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	LDB17	Q12342	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SEY1	Q99287	776 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YLR462W	O13556	202 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CYC3	P06182	269 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RAD1	P06777	1100 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SRB2	P34162	210 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	BLI1	P35727	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MSG5	P38590	489 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YHL049C	P38722	271 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SER3	P40054	469 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YFL064C	P43540	174 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MND1	P53102	219 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HOP2	P53187	214 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TIM13	P53299	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MTM1	P53320	366 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HER2	Q03557	464 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	AIM32	Q04689	311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HAP2	P06774	265 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CKI1	P20485	582 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CPR2	P23285	205 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MGT1	P26188	188 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MEI4	P29467	408 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MED6	P38782	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YIL054W	P40524	105 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ZIM17	P42844	174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YFL040W	P43562	540 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
THP2	YHR167W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HOT1	Q03213	719 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	IMA2	Q08295	589 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	GPM2	Q12008	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SPO7	P18410	259 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CDC42	P19073	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	KAR9	P32526	644 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YEL045C	P32616	141 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TKL2	P33315	681 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	COY1	P34237	679 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RPC37	P36121	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	JLP2	P40206	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PAN6	P40459	309 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	VHS2	P40463	436 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ALF1	P53904	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TAF9	Q05027	157 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	VPS54	Q12071	889 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DAS2	Q12084	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MED2	Q12124	431 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ATG34	Q12292	412 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ISA2	Q12425	185 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MTR10	Q99189	972 aa		3.1	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CDC8	P00572	216 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RAD3	P06839	778 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
THP2	YHR167W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PEX34	P25584	144 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	LDB16	P25587	256 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SIF2	P38262	535 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SLX1	P38324	304 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	POP4	P38336	279 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YMR134W	P40207	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	EFM4	P40516	257 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	INA22	P40576	216 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YPS6	P40583	537 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	UFE1	P41834	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YJR079W	P47126	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91

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