RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	QRI7	P43122	407 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TOS2	P50078	622 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MEP3	P53390	489 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NUP49	Q02199	472 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RSF1	Q05043	376 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YDR262W	Q12331	272 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MET2	P08465	486 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	PTP1	P25044	335 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	PTR2	P32901	601 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SEC66	P33754	206 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RCY1	P39531	840 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SNM1	P40993	198 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RET2	P43621	546 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SUN4	P53616	420 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SRL4	Q03085	281 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SNZ1	Q03148	297 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MAK3	Q03503	176 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GPI17	Q04080	534 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MGR3	Q04472	501 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NAT4	Q04751	285 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RBD2	Q12270	262 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	LAG2	Q92325	660 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YOR019W	Q99248	730 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RPB5	P20434	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ARO7	P32178	256 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GID8	P40208	455 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YPS6	P40583	537 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ECL1	P48235	211 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YGR168C	P53293	376 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MDM36	Q06820	579 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YDL114W	Q07530	308 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SIA1	Q12212	622 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	WHI5	Q12416	295 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	REP1	P03871	373 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TFS1	P14306	219 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	HCM1	P25364	564 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	OAC1	P32332	324 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NDC1	P32500	655 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SRO77	P38163	1010 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ECM34	P38728	170 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FMP52	P40008	231 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	IBA57	P47158	497 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NUP57	P48837	541 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ASI1	P54074	624 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YPL068C	Q02749	293 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NEJ1	Q06148	342 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CDA2	Q06703	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FDH1	Q08911	376 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	HOP1	P20050	605 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SSH4	P32343	579 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SRB5	P32585	307 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	OAR1	P35731	278 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FES1	P38260	290 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RTC2	P38279	296 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YNL195C	P40168	261 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	LTP1	P40347	161 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SSY5	P47002	699 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MAL11	P53048	616 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YDR541C	Q03049	344 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ABZ2	Q03266	374 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GAL83	Q04739	417 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	STP3	Q05937	343 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	IRC13	Q08630	104 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RKM5	Q12367	367 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RPN13	O13563	156 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CBS1	P14066	229 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YMC1	P32331	307 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MSN2	P33748	704 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	JLP2	P40206	208 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	AIM20	P40451	204 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	HOC1	P47124	396 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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