RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	GIS3	Q12418	502 aa		4.17	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	MTR10	Q99189	972 aa		4.17	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SNT2	P53127	1403 aa		4.17	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	VPS15	P22219	1454 aa		4.17	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	BNI1	P41832	1953 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	CHS1	P08004	1131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SNT1	P25357	1226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	NAM9	P27929	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	HXT1	P32465	570 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	YER085C	P40058	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	OTU1	P43558	301 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	BRO1	P48582	844 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	YGR042W	P53227	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	GOR1	P53839	350 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	VAC7	P53950	1165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	RMI1	Q02685	241 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	PET117	Q02771	107 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	VPS60	Q03390	229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SIL1	Q08199	421 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	CDC25	P04821	1589 aa		4.15	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ARG80	P07249	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ATP7	P30902	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ECM25	P32525	599 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HCS1	P34243	683 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	STB6	P36085	766 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HEL1	P36113	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CHK1	P38147	527 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YBR242W	P38331	238 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SOK1	P40317	901 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	UFE1	P41834	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	FMS1	P50264	508 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	LIF1	P53150	421 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	IRC4	Q03036	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ARO80	Q04052	950 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CSI1	Q04368	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	PEX12	Q04370	399 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HSP31	Q04432	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SMA2	Q04658	369 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	NDE2	Q07500	545 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ESA1	Q08649	445 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	AEP3	Q12089	606 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MSH5	Q12175	901 aa		4.15	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CPR2	P23285	205 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SIN4	P32259	974 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CYM1	P32898	989 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MAL32	P38158	584 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	TAE1	P38340	232 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YER184C	P39961	794 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	FMC1	P40491	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	REE1	P40893	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CHS6	P40955	746 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ECM27	P47144	725 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YIP1	P53039	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MAL12	P53341	584 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SRL4	Q03085	281 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	UBX2	Q04228	584 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	GPM3	Q12326	303 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CAT8	P39113	1433 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MSF1	P08425	469 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	DBF2	P22204	572 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	YIM1	P28625	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	SDH3	P33421	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
WSS1	YHR134W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
WSS1	YHR134W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52 ms