RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B TY3A-IQ99219 290 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRPL8P22353 238 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CNA1P23287 553 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PEX1P24004 1043 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HSP30P25619 332 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CDC15P27636 974 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HSP104P31539 908 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRPS5P33759 307 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YKL187CP34231 750 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HMT1P38074 348 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ZTA1P38230 334 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data-0.69□□□□□ -2.52not detected
YHL009W-BYHL009W-B AST2P39945 430 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YMR147WP40218 223 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YPL073CP40323 161 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LRO1P40345 661 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MAM33P40513 266 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B FYV8P46949 817 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YIP1P53039 248 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HHT1P61830 136 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B IRC4Q03036 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YMR130WQ04223 302 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TAZ1Q06510 381 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MSA1Q08471 629 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B FCY22Q12119 530 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PSF3Q12146 194 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LEU9Q12166 604 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HRT3Q12347 344 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SCC2Q04002 1493 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MF(ALPHA)1P01149 165 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CYC3P06182 269 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PMR1P13586 950 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MIG1P27705 504 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PMT2P31382 759 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPN2P32565 945 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B COY1P34237 679 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SNU114P36048 1008 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TCD2P36101 447 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SLM6P38343 150 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MBB1P39534 108 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YAL037WP39728 267 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ATG27P46989 271 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ORC1P54784 914 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PRP42Q03776 544 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B API2Q04413 109 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RTT109Q07794 436 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MED2Q12124 431 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MDY2Q12285 212 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YLR111WQ12528 110 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YBL008W-AQ3E821 79 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YOR338WQ99326 363 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPB2P08518 1224 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ATP10P18496 279 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B OCA4P25366 362 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MKK1P32490 508 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YME2P32843 850 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SWE1P32944 819 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YKL050CP35736 922 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RFT1P38206 574 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GDI1P39958 451 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AVT2P39981 480 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B FCY21P40039 528 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TRS85P46944 698 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RTT101P47050 842 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MDE1P47095 244 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GPG1P53130 126 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SHY1P53266 389 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B IDP3P53982 420 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ATG39Q06159 398 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B DXO1Q06349 442 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CTS2Q06350 511 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B IMH1Q06704 911 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CSI2Q08054 341 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B APC5Q08683 685 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RSF2P46974 1380 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PEP4P07267 405 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SEN2P16658 377 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPC53P25441 422 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RER1P25560 188 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TKL2P33315 681 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SSH1P38353 490 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ARN2P38724 620 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YAR068WP39564 161 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AIM2P39721 246 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PCL6P40038 420 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B OSW7P43611 510 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YPS5P53057 165 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B HXT11P54862 567 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PPN1Q04119 674 aa-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YLR345WQ06137 509 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.4 ms