RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W BAT2P47176 376 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W DIA3P52290 468 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MRPL13Q02204 264 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data7.52□□□□□ -1.21not detected
YRF1-3YGR296W CWP1P28319 239 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YJU3P28321 313 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W HEM14P40012 539 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ERP4Q12450 207 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RRI1Q12468 440 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-FP0CX61 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-GR2P0CX62 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-CP25383 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CWC24P53769 259 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MSC1Q03104 513 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-DR2Q03483 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W AIM36Q03798 255 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SSK1Q07084 712 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-BQ12260 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-OR2Q12293 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-DR1Q12392 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-OR1Q12439 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TY2A-DR3Q99303 438 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CDC26P14724 124 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NUD1P32336 851 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NOP16P40007 231 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W BRR6P53062 197 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SCL1P21243 252 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TOK1P40310 691 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W LTP1P40347 161 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TSA2Q04120 196 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PST2Q12335 198 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ATG15P25641 520 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W AIM29P36154 155 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RTS2P40962 232 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W GLC8P41818 229 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W BIO3P50277 480 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W BRE4Q07660 1125 aa7.51□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W DAP2P18962 818 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YHR122WP38829 231 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TIF34P40217 347 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ADO1P47143 340 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SSN8P47821 323 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RAI1P53063 387 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YDL114WQ07530 308 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YFH1Q07540 174 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W GSH2Q08220 491 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ATG31Q12421 196 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SMP3Q04174 516 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PEX30Q06169 523 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ECM30Q06673 1274 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TEN1Q07921 160 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PHO91P27514 894 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SOF1P33750 489 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YPK3P38070 525 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W FTH1P38310 465 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YER137CP40083 148 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YAT1P80235 687 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CAB5Q03941 241 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PUS9Q12069 462 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MRPL3P36516 390 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ROY1Q04847 553 aa7.5□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MET2P08465 486 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CPR2P23285 205 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W HXT2P23585 541 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ADE1P27616 306 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YHR180WP38868 163 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ISC1P40015 477 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ERG10P41338 398 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W COX16P47081 118 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RHO1P06780 209 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SHO1P40073 367 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data7.49□□□□□ -1.21 RIP-Chip
YRF1-3YGR296W NUP53Q03790 475 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YOL019WQ08157 551 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TPO4Q12256 659 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SEC12P11655 471 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NUP1P20676 1076 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W DAD2P36162 133 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W FAA3P39002 694 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W VMA7P39111 118 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PRP39P39682 629 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SHR5P41912 237 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NAS6P50086 228 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W AIM6Q07716 390 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CRT10Q08226 957 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W RAD59Q12223 238 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SUL2Q12325 893 aa7.49□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YIL177CP40434 1758 aa7.49□□□□□ -1.21
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