RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	YER184C	P39961	794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SER3	P40054	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BUR6	P40096	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MSS2	P40990	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MRK1	P50873	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MAL11	P53048	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DAM1	P53267	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HOL1	P53389	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ATG17	Q06410	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	LOT6	Q07923	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MXR2	P25566	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YCR102C	P25608	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TRS65	P32893	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ECM8	P38246	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YBR285W	P38354	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SOH1	P38633	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ARN2	P38724	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ANS1	P38832	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SWD1	P39706	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	FMP52	P40008	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PKP1	P40530	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	POP1	P41812	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	IRC6	P43615	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SLD3	P53135	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TPC1	P53257	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MTQ1	P53944	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MLC2	Q06580	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DCI1	Q08558	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GRE1	Q08969	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MCP1	Q12106	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TPO4	Q12256	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SET6	Q12529	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ERD1	P16151	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MRPS28	P21771	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	UBC8	P28263	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	EHD3	P28817	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PDR3	P33200	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SLC1	P33333	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NSG1	P38837	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	COG3	P40094	801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SOK1	P40317	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ECL1	P48235	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CUZ1	P53899	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PFA5	Q03289	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HED1	Q03937	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BUR2	Q05949	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RAX1	Q08760	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SIA1	Q12212	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TRM10	Q12400	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MED11	Q99278	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SEC12	P11655	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PHO80	P20052	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NUP1	P20676	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GPI12	P23797	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RHB1	P25378	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPT7	P32939	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NIC96	P34077	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SEA4	P38164	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	FMP23	P38231	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CTF8	P38877	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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