RNA–Protein interactions for RNA: YCL036W

GFD2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GFD2, Length 1,701 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD2	YCL036W	YOR062C	P36025	268 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	YHR035W	P38769	630 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	YJL055W	P47044	245 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	INP1	Q03694	420 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	YPR091C	Q06833	770 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	UIP4	Q08926	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	TOD6	P34219	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	OST6	Q03723	332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	RCN2	Q12044	265 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GFD2	YCL036W	PUP2	P32379	260 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ORC2	P32833	620 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YKL077W	P36081	392 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	BUR6	P40096	142 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YEH1	Q07804	573 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YLR040C	Q07988	224 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	MXR2	P25566	168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	VPS51	P36116	164 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	PZF1	P39933	429 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	TIM54	P47045	478 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SMA2	Q04658	369 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	GAL4	P04386	881 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	CWP1	P28319	239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ANS1	P38832	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	NVJ1	P38881	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FCY21	P40039	528 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	STB1	P42845	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YLR173W	Q06247	608 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	BRE4	Q07660	1125 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YLR030W	Q07967	263 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YOR214C	Q12282	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ERD1	P16151	362 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	BET3	P36149	193 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SMK1	P41808	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RNH70	P53331	553 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	MKC7	P53379	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RAS1	P01119	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SNF5	P18480	905 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YPT7	P32939	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ECM15	P35195	104 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	BNA5	Q05979	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YPS7	Q06325	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YOR365C	Q08844	703 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FRE5	Q08908	694 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RPS27B	P38711	82 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YHK8	P38776	514 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	CHL4	P38907	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FDC1	Q03034	503 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YPQ2	Q06328	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YPR172W	Q06608	200 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	IMG1	P25626	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	KAP122	P32767	1081 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SUR1	P33300	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	MCM7	P38132	845 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SHE1	P38200	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	CFD1	P40558	293 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RCF1	Q03713	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FMP27	Q06179	2628 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SAC7	P17121	654 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	ZRT3	P34240	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	YIL152W	P40455	235 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FET5	P43561	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	IRC6	P43615	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	PGA1	P53896	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	URC2	Q04411	772 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	PEX27	Q08580	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	PCL9	Q12477	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GFD2	YCL036W	FMC1	P40491	155 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	YGR012W	P53206	393 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	YLR346C	Q06139	101 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	YOR238W	Q08634	303 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	BAR1	P12630	587 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GFD2	YCL036W	SPT20	P50875	604 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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