RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	IMP2'	P32351	346 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SWE1	P32944	819 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	GPI16	P38875	610 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TOS3	P43637	560 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TDA1	Q03533	586 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	GAS2	Q06135	555 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YLR456W	Q06199	204 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ECM7	Q06200	448 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SRO7	Q12038	1033 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CEX1	Q12453	761 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.63	□□□□□ -2.31	not detected
HAL9	YOL089C	ADK2	P26364	225 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	DTR1	P38125	572 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	FRT2	P39734	528 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	STB1	P42845	420 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CIK1	Q01649	594 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SMP3	Q04174	516 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	BUG1	Q12191	341 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CDC25	P04821	1589 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TAF11	Q04226	346 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MDM36	Q06820	579 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	LOT6	Q07923	191 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SRL2	Q12020	392 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ATG34	Q12292	412 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RTP1	Q12751	981 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	DOP1	Q03921	1698 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	QDR3	P38227	689 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ASG7	P46993	209 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MST27	P53176	234 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MRX8	Q05473	314 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YOL029C	Q08187	201 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ULS1	Q08562	1619 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	STE2	D6VTK4	431 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SCEI	P03882	235 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RPC53	P25441	422 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TIR2	P33890	251 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PRY2	P36110	329 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YBL028C	P38202	106 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ECM34	P38728	170 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PEX22	P39718	180 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SER3	P40054	469 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	JLP2	P40206	208 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YNL320W	P42840	284 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	BIO3	P50277	480 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RSC1	P53236	928 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YGR117C	P53270	476 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TAF12	Q03761	539 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	URH1	Q04179	340 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	FCY22	Q12119	530 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YOP1	Q12402	180 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TFC7	Q12415	435 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SEC66	P33754	206 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YKL071W	P36086	256 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YAL037W	P39728	267 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MEH1	Q02205	184 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MRX11	Q03079	207 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TAP42	Q04372	366 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YDL109C	Q12103	647 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SPT7	P35177	1332 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ALG1	P16661	449 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CTR86	P25355	563 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YSC83	P32792	385 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PEX5	P35056	612 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	AST1	P35183	429 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	TCB2	P48231	1178 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	HCH1	P53834	153 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	BUR2	Q05949	395 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YLR177W	Q06251	628 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SHS1	Q07657	551 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SCM3	Q12334	223 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	APC2	Q12440	853 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PAN1	P32521	1480 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CPR2	P23285	205 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YEF1	P32622	495 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MDL1	P33310	695 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ATG18	P43601	500 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MDM30	Q05930	598 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	LDS2	Q08218	356 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YDL199C	Q12407	687 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RPO31	P04051	1460 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SPS100	P13130	326 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31

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