RNA–Protein interactions for RNA: YOL082W

ATG19, Transcript of Receptor protein for the cytoplasm-to-vacuole targeting (Cvt) pathway, yeastyeast

Gene ATG19, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG19YOL082W RRN9P53437 365 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W URC2Q04411 772 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ASA1Q06822 443 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PCL9Q12477 304 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YPK9Q12697 1472 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W TIR2P33890 251 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W CIK1Q01649 594 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W MCH1Q07376 486 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PEP1P32319 1579 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YDR541CQ03049 344 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W GYL1Q04322 720 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W NDL1Q06568 189 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ESP1Q03018 1630 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W STE7P06784 515 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W SPO23P33757 523 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YIP5P53108 310 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W POL1P13382 1468 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W GIT1P25346 518 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W DPH2P32461 534 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W TOA2P32774 122 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W MPE1P35728 441 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YML6P51998 286 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W FLC3P53121 802 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W RTT102P53330 157 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ERO1Q03103 563 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W LDS2Q08218 356 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W SCC2Q04002 1493 aa3.34□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W CMK2P22517 447 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W SEC9P40357 651 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W REX2P54964 269 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MEH1Q02205 184 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W IES4Q08561 116 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W HMS1Q12398 434 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W PXA2P34230 853 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W ABM1P47146 123 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YMR010WQ03687 405 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W AAD15Q08361 143 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPO31P04051 1460 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W UFD4P33202 1483 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W STU1P38198 1513 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W ECT1P33412 323 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W SOL2P37262 315 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W KAP104P38217 918 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MNL1P38888 796 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W VHT1P53241 593 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MSC3Q05812 728 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MCT1Q12283 360 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YOR1P53049 1477 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W SMC4Q12267 1418 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RNA1P11745 407 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W WSC4P38739 605 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W LCB2P40970 561 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YFL012WP43580 148 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W KEG1P43614 200 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W CHD1P32657 1468 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W PFF1P38244 976 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W BMT2P38278 337 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W PEX22P39718 180 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W EFM4P40516 257 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YJL055WP47044 245 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YPL107WQ02873 248 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W BPT1P14772 1559 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W RKR1Q04781 1562 aa3.29□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MYO4P32492 1471 aa3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W CIN2P46670 268 aa3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W VPS9P54787 451 aa3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W IPK1Q06667 281 aa3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ATG19YOL082W MLH1P38920 769 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W YER184CP39961 794 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W VAC7P53950 1165 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W YLR177WQ06251 628 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W PIN3Q06449 215 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W SFM1Q12314 213 aa3.27□□□□□ -1.89
ATG19YOL082W RAX2Q12465 1220 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28 ms