RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	HSL1	P34244	1518 aa		3.55	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	TOA2	P32774	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YBL028C	P38202	106 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	RCF1	Q03713	159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	FUN26	P31381	517 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	MRP21	P38175	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YER186C	P40101	306 aa		3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	MRPL8	P22353	238 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	PUP2	P32379	260 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	SPO23	P33757	523 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	RXT2	P38255	430 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YHR177W	P38867	453 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	MKC7	P53379	596 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	YFH1	Q07540	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KAR5	YMR065W	COX4	P04037	155 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	ZRC1	P20107	442 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MID2	P36027	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	GPI18	P38211	433 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	HMS1	Q12398	434 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	PSK1	P31374	1356 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	PRB1	P09232	635 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	DEP1	P31385	405 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	PFS1	P38872	237 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	TIM17	P39515	158 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	ABM1	P47146	123 aa		3.5	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	EOS1	P53938	366 aa		3.5	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.5	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.5	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	STE7	P06784	515 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	IGD1	P43598	195 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	KTR6	P54070	446 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MDS3	P53094	1487 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	GIT1	P25346	518 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	VHS1	Q03785	461 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	PEX27	Q08580	376 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	SKS1	Q12505	502 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	DAD2	P36162	133 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	YPS5	P53057	165 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MSC3	Q05812	728 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	SHS1	Q07657	551 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	FRE6	Q12473	712 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	REV3	P14284	1504 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	BUD4	P47136	1447 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	PSO2	P30620	661 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MSK1	P32048	576 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	YSW1	P38280	609 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	SNL1	P40548	159 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	CIN2	P46670	268 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	MPS2	P53159	387 aa		3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
KAR5	YMR065W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SOL2	P37262	315 aa		3.46	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SEC9	P40357	651 aa		3.46	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RET3	P53600	189 aa		3.46	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	GAT3	Q07928	141 aa		3.46	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	HEM4	P06174	275 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	CMK2	P22517	447 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MSP1	P28737	362 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	WSC4	P38739	605 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YGL262W	P53054	175 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	PEP1	P32319	1579 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	HIR3	P47171	1648 aa		3.45	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MAS2	P11914	482 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	LDS1	P31379	325 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SEO1	P39709	593 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	KEG1	P43614	200 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YLH47	Q06493	454 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MCH1	Q07376	486 aa		3.44	□□□□□ -1.86

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