RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	MMS21	P38632	267 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FHL1	P39521	936 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YJL107C	P42947	387 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	BST1	P43571	1029 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SIP4	P46954	829 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IBA57	P47158	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HXT16	P47185	567 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ECM9	Q02202	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	THI7	Q05998	598 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MFG1	Q07684	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LDB18	Q07887	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	THI20	Q08224	551 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RSB1	Q08417	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
RRN11	YML043C	SFM1	Q12314	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MED11	Q99278	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	REP2	P03872	296 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TPK3	P05986	398 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DST1	P07273	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MIH1	P23748	554 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GPI10	P30777	616 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YBR013C	P38215	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	BIT2	P38346	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MLH1	P38920	769 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GIP4	P39732	760 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MIT1	P40002	666 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GAB1	P41733	394 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PHO86	P46956	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NET1	P47035	1189 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SNN1	P48232	102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRX6	P48564	524 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	POP6	P53218	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SPC98	P53540	846 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	INN1	P53901	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	REG1	Q00816	1014 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TRS31	Q03337	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	REX4	Q08237	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TGS1	Q12052	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RBD2	Q12270	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PSY3	Q12318	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	AFI1	Q99222	893 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RIF1	P29539	1916 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PRC1	P00729	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SNF3	P10870	884 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SPO16	P17122	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GRR1	P24814	1151 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	AHC2	P25649	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CDC20	P26309	610 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YUR1	P26725	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YEL020C	P39994	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	AGP3	P43548	558 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRX5	P47007	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	BIO3	P50277	480 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YGR017W	P53210	297 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CPR8	P53728	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HXT11	P54862	567 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YDC1	Q02896	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MSC1	Q03104	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SLD5	Q03406	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GAS2	Q06135	555 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SCP1	Q08873	200 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CSM4	Q08955	156 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SPC3	Q12133	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HRT3	Q12347	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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