RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W GGC1P38988 300 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PSD1P39006 500 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VPS52P39904 641 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YER010CP40011 234 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GAT2P40209 560 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PFK26P40433 827 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W UTP25P40498 721 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MSY1P48527 492 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MEP3P53390 489 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PET117Q02771 107 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CRN1Q06440 651 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SWA2Q06677 668 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W OPY2Q06810 360 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YDR056CQ12025 205 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CDC21P06785 304 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NSP1P14907 823 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MSS116P15424 664 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PDA1P16387 420 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ERG8P24521 451 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CLB1P24868 471 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YCR043CP25361 127 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SMI1P32566 505 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SUI1P32911 108 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TUL1P36096 758 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RRT2P38332 387 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W APE4P38821 490 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RTT107P38850 1070 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W FLO9P39712 1322 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NDE1P40215 560 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YIL169CP40442 995 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YIR014WP40570 242 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VMA13P41807 478 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BRO1P48582 844 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YGR015CP53208 328 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MKC7P53379 596 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W DCP2P53550 970 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W IGO1P53897 168 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W FAR10Q06001 478 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GAS2Q06135 555 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YDL121CQ07541 149 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GSH2Q08220 491 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NUS1Q12063 375 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ATG29Q12092 213 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W AVL9Q12500 764 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YOR019WQ99248 730 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VCX1Q99385 411 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PCT1P13259 424 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SPO12P17123 173 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RPI1P23250 407 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ROX1P25042 368 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ERG9P29704 444 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TPS2P31688 896 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MRP20P32387 263 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ERG1P32476 496 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BLI1P35727 113 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SCO2P38072 301 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RKM3P38222 552 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CCT4P39078 528 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PRP39P39682 629 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W DPH1P40487 425 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RPL10P41805 221 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PET130P47065 347 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YJR149WP47177 404 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TIS11P47977 285 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ROG1P53118 685 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MAL12P53341 584 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ALF1P53904 254 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SWF1Q04629 336 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PDR8Q06149 701 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MCH4Q08268 501 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NKP1Q12493 238 aa1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W URA2P07259 2214 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data1.96□□□□□ -2.1not detected
SSQ1YLR369W YBR062CP38239 180 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W SMF2P38778 549 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W YEL068CP39977 110 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W SEC27P41811 889 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W YFL012WP43580 148 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W RPE1P46969 238 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W UBP8P50102 471 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W YML6P51998 286 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W KAP114P53067 1004 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W GAS3Q03655 524 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W TAF12Q03761 539 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W YLR287CQ05881 355 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W REX3Q12090 404 aa1.96□□□□□ -2.1
SSQ1YLR369W STE2D6VTK4 431 aa1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.7 ms