RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	YAT2	P40017	923 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ECM27	P47144	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NUP84	P52891	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NBP35	P52920	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YNL234W	P53857	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	POS5	Q06892	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ATG10	Q07879	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	LDB18	Q07887	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NRT1	Q08485	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	GAL4	P04386	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RIP1	P08067	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	TYR1	P20049	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	MGT1	P26188	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	CBP4	P37267	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YSW1	P38280	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	PHO90	P39535	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YPS6	P40583	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NMD5	P46970	1048 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	GLG2	P47011	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YJR154W	P47181	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	OCA2	P53949	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	CDC14	Q00684	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ECI1	Q05871	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	FRE7	Q12333	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YPR089W	O13585	888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RHB1	P25378	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NDI1	P32340	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	POP4	P38336	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	WSC4	P38739	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	PFS1	P38872	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	VHS2	P40463	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SYG1	P40528	902 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SNO3	P43544	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	FET5	P43561	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	MDE1	P47095	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	OSW1	Q08692	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	REX3	Q12090	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	QCR6	P00127	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SUC2	P00724	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	PMR1	P13586	950 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	GID7	P25569	745 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	AEP1	P32493	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SCO2	P38072	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SMF2	P38778	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SCC4	P40090	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YJL070C	P40361	888 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	DSN1	P40568	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	GPI8	P49018	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	SWC4	P53201	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YNL143C	P53908	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	NUP100	Q02629	959 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	CAC2	Q04199	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	HER1	Q12276	1246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIA2	YHR122W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	COX3	P00420	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	BAR1	P12630	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	DAP2	P18962	818 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	YCL068C	P25593	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	SIN4	P32259	974 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	ATP11	P32453	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	UTH1	P36135	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	MMS21	P38632	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	YFL012W	P43580	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	TOM22	P49334	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	FRE4	P53746	719 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	RHO4	Q00246	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIA2	YHR122W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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