RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	DUG3	P53871	357 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AAT1	Q01802	451 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	OST6	Q03723	332 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NUP53	Q03790	475 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MLH3	Q12083	715 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ERP3	Q12403	225 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SEN2	P16658	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YMR31	P19955	123 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RAD57	P25301	460 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MXR2	P25566	168 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
SLX8	YER116C	IES6	P32617	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MSN2	P33748	704 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SPO23	P33757	523 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	DTR1	P38125	572 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RPH1	P39956	796 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YMR134W	P40207	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AGE2	P40529	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	GET1	P53192	235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	BIO4	P53630	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SNO2	P53823	222 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ATG4	P53867	494 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MPS1	P54199	764 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MRS2	Q01926	470 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PFA5	Q03289	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	UBX2	Q04228	584 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PLM2	Q04383	521 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SEC10	Q06245	871 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	IMA2	Q08295	589 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	USV1	Q12132	391 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
SLX8	YER116C	SNF8	Q12483	233 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	QCR7	P00128	127 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CHO1	P08456	276 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	KAR4	P25583	335 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TAF14	P35189	244 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CHK1	P38147	527 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AME1	P38313	324 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SYG1	P40528	902 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	COX16	P47081	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PKP2	P53170	491 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YGR151C	P53287	111 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	KRE28	Q04431	385 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	HSP31	Q04432	237 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NAT4	Q04751	285 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ASA1	Q06822	443 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RKI1	Q12189	258 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	QCR2	P07257	368 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RPO26	P20435	155 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MRPL8	P22353	238 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PPZ1	P26570	692 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MEI4	P29467	408 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	FIG1	P38224	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YBR053C	P38235	358 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SUL1	P38359	859 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YER121W	P40076	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SLM1	P40485	686 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YKE4	P40544	346 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YIR016W	P40572	265 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AGP3	P43548	558 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RPC17	P47076	161 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NAS6	P50086	228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	UBP8	P50102	471 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	UBC11	P52492	156 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YIP3	P53633	176 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RIM13	Q03792	727 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TMN2	Q04562	672 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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