RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SYG1	P40528	902 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YGR067C	P53243	804 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TRS23	Q03784	219 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	UBX2	Q04228	584 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CKI1	P20485	582 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ADE1	P27616	306 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YKL162C	P36052	402 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RIB1	P38066	345 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YJL163C	P46996	555 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RIM8	P53179	542 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YGR168C	P53293	376 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YNR014W	P53719	212 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SAM50	P53969	484 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	IVY1	Q04934	453 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	HRD3	Q05787	833 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SPO77	Q06134	477 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ENB1	Q08299	606 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	LAS17	Q12446	633 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MAS2	P11914	482 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CLN3	P13365	580 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DAL82	P21705	255 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RAD57	P25301	460 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RAD24	P32641	659 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MIA40	P36046	403 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	VPS51	P36116	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	FMP52	P40008	231 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	UBP8	P50102	471 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	KRE28	Q04431	385 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MSH5	Q12175	901 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	OPI3	P05375	206 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RAD7	P06779	565 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DST1	P07273	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YAK1	P14680	807 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	BIO4	P53630	237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	AAT1	Q01802	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YLR224W	Q05947	369 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SUT2	Q12286	268 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	WHI2	P12611	486 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TYR1	P20049	452 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MXR2	P25566	168 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MRPL22	P53881	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PFA5	Q03289	374 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SMP3	Q04174	516 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SEY1	Q99287	776 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	STE18	P18852	110 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RSM22	P36056	628 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YIL001W	P40560	513 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	POP1	P41812	875 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	COX16	P47081	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YPR003C	P53394	754 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YTP1	P53584	459 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SNO2	P53823	222 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YNL181W	P53878	407 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MPS1	P54199	764 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CDC123	Q05791	360 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DCR2	Q05924	578 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CDA2	Q06703	312 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YDL177C	Q12257	170 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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