RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YLR224W	Q05947	369 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	AFT2	Q08957	416 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RGS2	Q99188	309 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DAL81	P21657	970 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	IFM1	P25038	676 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RRT12	P25381	491 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YCL049C	P25577	312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GEX1	P25596	615 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PRE4	P30657	266 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MRPL9	P31334	269 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	LDS1	P31379	325 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SUA5	P32579	426 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RML2	P32611	393 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ECT1	P33412	323 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SRB2	P34162	210 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	IST2	P38250	946 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PGD1	P40356	397 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	FMC1	P40491	155 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YIL024C	P40543	189 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GAB1	P41733	394 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SNG1	P46950	547 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	AAD10	P47182	288 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HLJ1	P48353	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TPN1	P53099	579 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	VPS9	P54787	451 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	AAT1	Q01802	451 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	UME1	Q03010	460 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YML037C	Q03703	340 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CAC2	Q04199	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HOF1	Q05080	669 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SPC3	Q12133	184 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CDC7	P06243	507 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SEC59	P20048	519 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CCA1	P21269	546 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MNS1	P32906	549 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	LST4	P34239	828 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CSG2	P35206	410 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ICS2	P38284	255 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	VHC1	P38329	1120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SHG1	P38337	142 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	NSG1	P38837	291 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YJL206C	P39529	758 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	UBP5	P39944	805 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ECM27	P47144	725 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DSD1	P53095	428 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SLD3	P53135	668 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HCH1	P53834	153 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ARG7	Q04728	441 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CRT10	Q08226	957 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PSF1	Q12488	208 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GAL7	P08431	366 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SNF4	P12904	322 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CSM1	P25651	190 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YOX1	P34161	385 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YBR241C	P38142	488 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YHR078W	P38799	552 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YKE4	P40544	346 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YFL052W	P43551	465 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SOL1	P50278	321 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MRPS35	P53292	345 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TIM44	Q01852	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YDC1	Q02896	317 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TVP18	Q04767	167 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	REX4	Q08237	289 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	UPC2	Q12151	913 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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