RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L21D6R901 530 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF9O43307 516 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 IRX4P78413 519 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 Q9H521 79 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 KPNA6O60684 536 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 MAN1A1P33908 653 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 P3H4Q92791 437 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC4O15439 1325 aa6.78□□□□□ -1.32
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