RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MYT1Q01538 1121 aa11.33□□□□□ -0.6
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PTPRB-210ENST00000551525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRB-210ENST00000551525 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC24A1O60721 1099 aa10.27□□□□□ -0.77
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRB-210ENST00000551525 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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PTPRB-210ENST00000551525 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-210ENST00000551525 NEFLP07196 543 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRB-210ENST00000551525 OSCARQ8IYS5 282 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRB-210ENST00000551525 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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PTPRB-210ENST00000551525 BCANQ96GW7 911 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-210ENST00000551525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-210ENST00000551525 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCA2P51531 1590 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRB-210ENST00000551525 C14orf37Q86TY3 774 aa8.78□□□□□ -1
PTPRB-210ENST00000551525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRB-210ENST00000551525 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-210ENST00000551525 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-210ENST00000551525 EEA1Q15075 1411 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM52Q96A61 297 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC8Q09428 1581 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 ITGAEP38570 1179 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 KIF27Q86VH2 1401 aa8.66□□□□□ -1.02
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