RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
KTR2	YKR061W	MRX5	P47007	382 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	AZR1	P50080	613 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YGL159W	P53110	370 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YGR127W	P53275	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	SPP2	Q02521	185 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	ROT1	Q03691	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	TAF12	Q03761	539 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	STP3	Q05937	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	IPK1	Q06667	281 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	DDC1	Q08949	612 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	RRD2	Q12461	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	QCR2	P07257	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	CBF1	P17106	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	PEX3	P28795	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	SSO1	P32867	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	CAF4	P36130	643 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	FIG1	P38224	298 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	IML3	P38265	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	ALP1	P38971	573 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YER130C	P39959	443 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	BUR6	P40096	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	SDP1	P40479	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	HXT9	P40885	567 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	PHB1	P40961	287 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YFL054C	P43549	646 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YAR1	P46683	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YJL118W	P47022	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	SNX4	P47057	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	COX16	P47081	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YGR042W	P53227	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	COX18	P53239	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	EFM6	P53970	246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	HXT11	P54862	567 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	CTF19	Q02732	369 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	COQ9	Q05779	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	DCR2	Q05924	578 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	SPO77	Q06134	477 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	CDD1	Q06549	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	MCM21	Q06675	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	REX4	Q08237	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	GPM2	Q12008	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
KTR2	YKR061W	VAM3	Q12241	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
KTR2	YKR061W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PUT2	P07275	575 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PDE1	P22434	369 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HXT2	P23585	541 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	MGR1	P25573	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CSM1	P25651	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ADE1	P27616	306 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YIM1	P28625	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	FRE1	P32791	686 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YBR144C	P34215	104 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	FZO1	P38297	855 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	AME1	P38313	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PFS1	P38872	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	BDH2	P39713	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	GAB1	P41733	394 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ARK1	P53974	638 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	STD1	Q02794	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PLB2	Q03674	706 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	KRE28	Q04431	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	VPS36	Q06696	566 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	CDA1	Q06702	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SYO1	Q07395	620 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NSE1	Q07913	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YEH2	Q07950	538 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PEX27	Q08580	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	MOT1	P32333	1867 aa		4.15	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	COX2	P00410	251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	GAL10	P04397	699 aa		4.14	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	DAL82	P21705	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms