RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	SRN2	Q99176	213 aa		4.25	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.25	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.25	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.25	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ERG3	P32353	365 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	MSN4	P33749	630 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PCA1	P38360	1216 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RFC3	P38629	340 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CIN5	P40917	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	BNA6	P43619	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	LOH1	P47055	219 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GYL1	Q04322	720 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	KRE28	Q04431	385 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ECM18	Q04623	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.24	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	HIP1	P06775	603 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	YAK1	P14680	807 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	MSP1	P28737	362 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	YOX1	P34161	385 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	SRB2	P34162	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CAF4	P36130	643 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CBP4	P37267	147 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	MED8	P38304	223 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	SMF1	P38925	575 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RSM25	P40496	264 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	NAS2	P40555	220 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	MSS2	P40990	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	POP1	P41812	875 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RRT5	P43607	289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	COX16	P47081	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CAF40	P53829	373 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ATC1	Q04005	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GTO3	Q04806	366 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	YPD1	Q07688	167 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RSA1	Q08932	381 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PAN1	P32521	1480 aa		4.23	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TSC11	P40061	1430 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CDC42	P19073	191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	UTR1	P21373	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GEX1	P25596	615 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	NDI1	P32340	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	VPH2	P32341	215 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	SUA5	P32579	426 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	CSE1	P33307	960 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	FRE2	P36033	711 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	SCC4	P40090	624 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PIB2	P53191	635 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	MNT4	P53745	580 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	ODC1	Q03028	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GIM5	Q04493	163 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	PSY3	Q12318	242 aa		4.22	□□□□□ -1.73
WSS1	YHR134W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SPS4	P09937	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	ATP10	P18496	279 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	ADK2	P26364	225 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	COT1	P32798	439 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	REC114	P32841	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	YBR139W	P38109	508 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	PRM9	P39551	298 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SSN8	P47821	323 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	YGR149W	P48236	432 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	YML108W	Q03759	105 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	URC2	Q04411	772 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	SPC24	Q04477	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	AIM32	Q04689	311 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSS1	YHR134W	VTA1	Q06263	330 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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