RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YPK3P38070 525 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RFS1P38234 210 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W APD1P38281 316 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YHB1P39676 399 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W AST2P39945 430 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YGR117CP53270 476 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SLM2P53955 656 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W LSM3P57743 89 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RSN1Q03516 953 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CDD1Q06549 142 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ECM30Q06673 1274 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YOL159CQ08300 171 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SGT1Q08446 395 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W UIP4Q08926 304 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YLR049CQ12110 428 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W NFI1Q12216 726 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CSR2Q12734 1121 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W GAL80P04387 435 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W NMT1P14743 455 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CBS2P14905 389 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VPS3P23643 1011 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CLB3P24870 427 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W NDI1P32340 513 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W NUP2P32499 720 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W TCD2P36101 447 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YBR241CP38142 488 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YHR054CP38780 354 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ELO1P39540 310 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W KRE29P40026 464 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W THO1P40040 218 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YJL070CP40361 888 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ATM1P40416 690 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SEC28P40509 296 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W GUF1P46943 645 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YNL095CP53932 642 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PFA5Q03289 374 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YLR352WQ06479 807 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FMP45Q07651 309 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ATG29Q12092 213 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SUT2Q12286 268 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ATG34Q12292 412 aa5.24□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W COX4P04037 155 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W TPK3P05986 398 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W MAK32P23060 363 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PHO91P27514 894 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W UBC8P28263 218 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ACH1P32316 526 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YBR144CP34215 104 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W EGD2P38879 174 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FAD1P38913 306 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ERV46P39727 415 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VAB2P40003 282 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RTT101P47050 842 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PET130P47065 347 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ALT2P52892 507 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SLG1P54867 378 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W URC2Q04411 772 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YMR321CQ04898 105 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ARR1Q06596 294 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RSA1Q08932 381 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YPL247CQ12523 523 aa5.23□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SUC2P00724 532 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PDA1P16387 420 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CMK2P22517 447 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W DBR1P24309 405 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PUP3P25451 205 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RME1P32338 300 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RGT1P32862 1170 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SPC34P36131 295 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ROT2P38138 954 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W IMD2P38697 523 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W COA1P40452 197 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CDC1P40986 491 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PEX31P53203 462 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W IPI3P53877 555 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RMI1Q02685 241 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RSC9Q03124 581 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W TLG1Q03322 224 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W TRM12Q04235 462 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W COA4Q05809 96 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W MDY2Q12285 212 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YOL159C-AQ3E769 90 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W MED11Q99278 115 aa5.22□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PUT2P07275 575 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CHO1P08456 276 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MRP13P12686 339 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MET16P18408 261 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
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