RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C PMT5P52867 743 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C GIP3Q03016 1276 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C IMA2Q08295 589 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RDR1Q08904 546 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FMP16Q12497 93 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SUC2P00724 532 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DST1P07273 309 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RSR1P13856 272 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MER1P16523 270 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPS2P25443 254 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YUR1P26725 428 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YMC1P32331 307 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C APE2P32454 952 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SPR1P32603 445 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C CBP4P37267 147 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C LAG1P38703 411 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YJR154WP47181 346 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DSL1P53847 754 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C INM2Q05533 292 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PIG1Q06216 648 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YLR173WQ06247 608 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RUP1Q12242 671 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C GLE1Q12315 538 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FRE7Q12333 620 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RKM5Q12367 367 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ADF1Q2V2Q1 113 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C HKR1P41809 1802 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ARG80P07249 177 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPB8P20436 146 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SAR1P20606 190 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MRPL25P23369 157 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DBR1P24309 405 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RAD57P25301 460 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SAT4P25333 603 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ADY2P25613 283 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RTC2P38279 296 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YHR122WP38829 231 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C AIM10P39965 576 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YGR117CP53270 476 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SOL4P53315 255 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YMR102CQ03177 834 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C TAF12Q03761 539 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C URC2Q04411 772 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C AIM33Q04516 312 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C BOP2Q06150 570 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YDL218WQ07629 317 aa4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YLL053CP0CD98 152 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPL12BP0CX54 165 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C GSY2P27472 705 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MSK1P32048 576 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PPZ2P33329 710 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YKL097CP34245 136 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.99□□□□□ -1.77not detected
ATG8YBL078C ARN1P38731 627 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YHR045WP38775 560 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FET3P38993 636 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RCY1P39531 840 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RAD17P48581 401 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PHB2P50085 310 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MPS1P54199 764 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C NUP53Q03790 475 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C APC4Q04601 652 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C DIC1Q06143 298 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SYO1Q07395 620 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C AAD15Q08361 143 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PFA4Q12006 378 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YPR022CQ12139 1133 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YLL056CQ12177 298 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C YDR262WQ12331 272 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FSH3Q99369 266 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C FLO11P08640 1367 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C CIN8P27895 1000 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C HXT1P32465 570 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C ECT1P33412 323 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C BIO3P50277 480 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C PCP1P53259 346 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MNT4P53745 580 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C EAF7P53911 425 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RHO4Q00246 291 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C MRP51Q02950 344 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RRN11Q04712 507 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C BCP1Q06338 283 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C NRT1Q08485 598 aa3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ATG8YBL078C GIS3Q12418 502 aa3.98□□□□□ -1.77
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