RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	DEP1	P31385	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
ATR1	YML116W	RRN10	P38204	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	SWC5	P38326	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	END3	P39013	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	YFL040W	P43562	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATR1	YML116W	MGR1	P25573	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	HMX1	P32339	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ECM25	P32525	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MRP4	P32902	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MIA40	P36046	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	BZZ1	P38822	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPR089W	O13585	888 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	UGA1	P17649	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CDC42	P19073	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RAD51	P25454	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	UBA4	P38820	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SPC97	P38863	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PCI8	P40512	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YIL060W	P40519	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SAS2	P40963	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PHO86	P46956	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YHC3	P47040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MND1	P53102	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YGL114W	P53134	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RTT102	P53330	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ASI1	P54074	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SPO19	Q03029	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GGA1	Q06336	557 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GEP3	Q08622	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
ATR1	YML116W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PMA2	P19657	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	HXT2	P23585	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SPS22	P25380	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	NTG1	P31378	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	EXO1	P39875	702 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SCC4	P40090	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GAT2	P40209	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	BRO1	P48582	844 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CAB5	Q03941	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	VAC14	Q06708	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	TYR1	P20049	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YCL068C	P25593	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PPZ1	P26570	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PEX18	P38855	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ALP1	P38971	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	POP1	P41812	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ERV41	Q04651	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	DSE3	Q08729	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GLE1	Q12315	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CDC43	P18898	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	INM1	P38710	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GTO1	P48239	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PKP2	P53170	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	IRC10	Q08118	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PEX27	Q08580	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CHS1	P08004	1131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MAS2	P11914	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MBR1	P23493	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ROT2	P38138	954 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RTT107	P38850	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SEG1	Q04279	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RRG8	Q06109	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	NSE1	Q07913	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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