RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	MDE1	P47095	244 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	TLG1	Q03322	224 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	NDE2	Q07500	545 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RAX1	Q08760	435 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	AEP3	Q12089	606 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YRM1	Q12340	786 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YCL068C	P25593	260 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	HEL1	P36113	551 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CHK1	P38147	527 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	COX14	P39103	70 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SER3	P40054	469 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	GAT2	P40209	560 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SHY1	P53266	389 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	STD1	Q02794	444 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MMT1	Q03218	510 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CEX1	Q12453	761 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	NAM2	P11325	894 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YIL029C	P40538	142 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MTQ1	P53944	314 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YLR152C	P54072	576 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	NTE1	Q04958	1679 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	LTV1	P34078	463 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SBE22	P38814	852 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	STN1	P38960	494 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	BRO1	P48582	844 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YGR111W	P53265	400 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CIK1	Q01649	594 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CCE1	Q03702	353 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CDC21	P06785	304 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	DST1	P07273	309 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	PHA2	P32452	334 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	HXT1	P32465	570 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MRPL10	P36520	322 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	FAD1	P38913	306 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SIM1	P40472	476 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.48	□□□□□ -2.01	not detected
YLR224W	YLR224W	TOS3	P43637	560 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	TIS11	P47977	285 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MRM2	P53123	320 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MDM36	Q06820	579 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	DCI1	Q08558	271 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	UAF30	Q08747	228 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	NCA2	Q12374	616 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CSE2	P33308	149 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	PXA2	P34230	853 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SLX1	P38324	304 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	INM1	P38710	295 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	CHS6	P40955	746 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	YML6	P51998	286 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ALF1	P53904	254 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ERO1	Q03103	563 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	RIF2	Q06208	395 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	JID1	Q12350	301 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	IZH2	Q12442	317 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	SSK2	P53599	1579 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	DRS2	P39524	1355 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YLR224W	YLR224W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	CAP2	P13517	287 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	MSI1	P13712	422 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YHR131C	P38835	850 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	GAB1	P41733	394 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PIB2	P53191	635 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ADA2	Q02336	434 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	LOT6	Q07923	191 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PLP2	Q12017	286 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	GPM3	Q12326	303 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PDE2	P06776	526 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RPB5	P20434	215 aa		2.45	□□□□□ -2.02

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms