RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YHR045WP38775 560 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W FMO1P38866 432 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MNL1P38888 796 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RCY1P39531 840 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ECM10P39987 644 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YIR016WP40572 265 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MPS3P47069 682 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W UBC11P52492 156 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RTT102P53330 157 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SRL4Q03085 281 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PDR8Q06149 701 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SHS1Q07657 551 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W NRT1Q08485 598 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W DSE3Q08729 430 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BTS1Q12051 335 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ARP6Q12509 438 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MYO1P08964 1928 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W JIP3O13555 125 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CDC43P18898 376 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YSP3P25036 478 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CNE1P27825 502 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W FLO10P36170 1169 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YHL026CP38740 315 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SPC97P38863 823 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W FMP52P40008 231 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PHM8P40025 321 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W AIM22P47051 409 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W NPA3P47122 385 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YGL185CP53100 379 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W OCA2P53949 197 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W KTR6P54070 446 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W AAT1Q01802 451 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YMR160WQ03823 816 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W STE23Q06010 1027 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MRPL35Q06678 367 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W POS5Q06892 414 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CRT10Q08226 957 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RUP1Q12242 671 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W GIS3Q12418 502 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YOS9Q99220 542 aa3.94□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CDC21P06785 304 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MAS1P10507 462 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SEC62P21825 274 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SPR1P32603 445 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W REC114P32841 428 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.93□□□□□ -1.78not detected
PIR3YKL163W RPC25P35718 212 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YKL071WP36086 256 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SCC4P40090 624 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YIR014WP40570 242 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W OTU1P43558 301 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BNA6P43619 295 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ATG27P46989 271 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ROG1P53118 685 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YGL108CP53139 140 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W DBP6P53734 629 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YNL260CP53846 198 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CYK3Q07533 885 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YDL242WQ07746 117 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W NSE1Q07913 336 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W TEN1Q07921 160 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PEX27Q08580 376 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W GLE1Q12315 538 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W FMP16Q12497 93 aa3.93□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MOT1P32333 1867 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MDM10P18409 493 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W HXT2P23585 541 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PSO2P30620 661 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CSE2P33308 149 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ELF1P36053 145 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W TSC10P38342 320 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W DBP8P38719 431 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YHR210CP38893 341 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ALP1P38971 573 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MBB1P39534 108 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YHB1P39676 399 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PAC11P40960 533 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SNM1P40993 198 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ESBP6P53918 673 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RSN1Q03516 953 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BNA7Q04066 261 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RDR1Q08904 546 aa3.92□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ATG9Q12142 997 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms