RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TUL1	P36096	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SKG1	P36169	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DER1	P38307	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PRE3	P38624	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	BTS1	Q12051	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SPS4	P09937	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SAC7	P17121	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CWP1	P28319	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	JEN1	P36035	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SPC34	P36131	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	POP4	P38336	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SRP14	P38985	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YEL020C	P39994	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FKH1	P40466	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CFD1	P40558	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	COS5	P47187	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RFX1	P48743	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	COS1	P53822	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CAF40	P53829	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ATG4	P53867	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YNL140C	P53910	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DAL4	Q04895	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SAM3	Q08986	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PSF1	Q12488	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DFG16	Q99234	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PEP5	P12868	1029 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RPB10	P22139	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SPT14	P32363	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HOG1	P32485	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SHP1	P34223	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TVP38	P36164	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YBR062C	P38239	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AIM46	P38885	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YER130C	P39959	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PSF2	P40359	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PMT6	P42934	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RGD2	P43556	714 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AZR1	P50080	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	GET1	P53192	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SNO1	Q03144	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TRM82	Q03774	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DCI1	Q08558	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DGK1	Q12382	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MRX4	Q12467	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RGS2	Q99188	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	ARG1	P22768	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	FPS1	P23900	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	ECM25	P32525	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	NAT2	P37293	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	RIB1	P38066	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	THI2	P38141	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	SHG1	P38337	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	PCA1	P38360	1216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	ERV46	P39727	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	PRK1	P40494	810 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	MAM33	P40513	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	BAP3	P41815	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	PPT1	P53043	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	YGL235W	P53071	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	YGL108C	P53139	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	ECM9	Q02202	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	THI22	Q06490	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	TMS1	Q12116	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	FMP16	Q12497	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	LYS2	P07702	1392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	CBP1	P07252	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSC7	YHR039C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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