RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MEI5	P32489	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MRE11	P32829	692 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SGE1	P33335	543 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ETR1	P38071	380 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BZZ1	P38822	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LNP1	P38878	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	GID8	P40208	455 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ATM1	P40416	690 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YIR016W	P40572	265 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UFE1	P41834	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SNG1	P46950	547 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YHC3	P47040	408 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BIT61	P47041	543 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RAD17	P48581	401 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RCF2	P53721	224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	HER2	Q03557	464 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	VPS36	Q06696	566 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SWC7	Q06707	132 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YET3	Q07451	203 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
MRP4	YHL004W	LCB4	Q12246	624 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TAF3	Q12297	353 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UBR1	P19812	1950 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SPO7	P18410	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	DAP2	P18962	818 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PDE1	P22434	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PET18	P25362	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SPS22	P25380	463 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	GID7	P25569	745 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YCL068C	P25593	260 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MTC7	P32633	139 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PEX32	P38292	413 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YBP1	P38315	674 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
MRP4	YHL004W	ELP2	P42935	788 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TDA10	P42938	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CTK2	P46962	323 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TAF6	P53040	516 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MTL1	P53214	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YNL143C	P53908	130 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	EFM6	P53970	246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CDC14	Q00684	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	FIN1	Q03898	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ARG7	Q04728	441 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	STP3	Q05937	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LDB18	Q07887	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	GSH2	Q08220	491 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LDB17	Q12342	491 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	POM34	Q12445	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SPE4	Q12455	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SIR3	P06701	978 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UNG1	P12887	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	URA4	P20051	364 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	AMD2	P22580	549 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	URK1	P27515	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SUA5	P32579	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SRB5	P32585	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SEC66	P33754	206 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PHO11	P35842	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TPO5	P36029	618 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PHO12	P38693	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CCT6	P39079	546 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YTP1	P53584	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SKO1	Q02100	647 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PIR3	Q03180	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CDC123	Q05791	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BSP1	Q06604	576 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UAF30	Q08747	228 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	FRE3	Q08905	711 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	AHC1	Q12433	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RGS2	Q99188	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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