RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W IMD4P50094 524 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MMT1Q03218 510 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W CSN9Q03981 162 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W HSP31Q04432 237 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W CDC123Q05791 360 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W GMC2Q06201 188 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YEH2Q07950 538 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W NRT1Q08485 598 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MUM3Q08750 479 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W VPS54Q12071 889 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ERP3Q12403 225 aa5.29□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MF(ALPHA)1P01149 165 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W HOM3P10869 527 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W KSS1P14681 368 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W PDX1P16451 410 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W TKL1P23254 680 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W CSM1P25651 190 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W PRR1P28708 518 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W BRF1P29056 596 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W SSE2P32590 693 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W PEX5P35056 612 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ASK1P35734 292 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MNN2P38069 597 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YHI9P38765 294 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W AIM18P38884 321 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W CYC2P38909 366 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YRB2P40517 327 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MSS2P40990 351 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MAF1P41910 395 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W AGP3P43548 558 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YJL055WP47044 245 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W AIF1P52923 378 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W RMR1P53060 241 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YGR127WP53275 312 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YNL033WP53964 284 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W YNL019CP53975 284 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W PLP1Q04004 230 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W MGR3Q04472 501 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ARO10Q06408 635 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ESA1Q08649 445 aa5.28□□□□□ -1.56
VHS1YDR247W ECM29P38737 1868 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W BCY1P07278 416 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RAP1P11938 827 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FAR1P21268 830 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RVS161P25343 265 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CTR86P25355 563 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SAC1P32368 623 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W RCN1P36054 211 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YBR139WP38109 508 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YHR182WP38870 785 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W PAC2P39937 518 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YAT2P40017 923 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.27□□□□□ -1.57not detected
VHS1YDR247W YJL132WP47014 750 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W GGA1Q06336 557 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SLD7Q08457 257 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W NSL1Q12143 216 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W HER1Q12276 1246 aa5.27□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W REP1P03871 373 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CHS1P08004 1131 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FBA1P14540 359 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
VHS1YDR247W CCA1P21269 546 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SMI1P32566 505 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W CSE1P33307 960 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SEF1P34228 1148 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SKG1P36169 355 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W IST2P38250 946 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FTH1P38310 465 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SRP72P38688 640 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VMA22P38784 181 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VMA13P41807 478 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ELP2P42935 788 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YJR054WP47114 497 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W EFM6P53970 246 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VPS9P54787 451 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W FMP30Q02883 468 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W GRC3Q07845 632 aa5.26□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W UGA1P17649 471 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W ART10P18634 518 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W MSS51P32335 436 aa5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W VMA6P32366 345 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
VHS1YDR247W OCT1P35999 772 aa5.25□□□□□ -1.57
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