RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K FAR8Q05040 523 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SFH1Q06168 426 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SGT1Q08446 395 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ESA1Q08649 445 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MLH3Q12083 715 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YVC1Q12324 675 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SPE4Q12455 300 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SNF8Q12483 233 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PSF1Q12488 208 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K STT4P37297 1900 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPP2BP02400 110 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PRT1P06103 763 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO2P07269 559 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K UNG1P12887 359 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CTA1P15202 515 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MAK32P23060 363 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG9P29704 444 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K AAR2P32357 355 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP150P32478 413 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K STE14P32584 239 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC61P32915 480 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K DOA1P36037 715 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HSM3P38348 480 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K TRR2P38816 342 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BZZ1P38822 633 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K DLD3P39976 496 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ZRG8P40021 1076 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC26P41810 973 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SHR5P41912 237 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL043WP47053 257 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K APS3P47064 194 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MRM2P53123 320 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PBP1P53297 722 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BSC5P53755 489 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GOR1P53839 350 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K IDP3P53982 420 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YSA1Q01976 231 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC15Q02733 499 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR541CQ03049 344 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR210WQ03649 449 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GLO2Q05584 274 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K FAR10Q06001 478 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS74Q06385 345 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA5Q06417 326 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR172WQ06608 200 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR091CQ06833 770 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YEH2Q07950 538 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR036CQ07986 203 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K FDH1Q08911 376 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K REX3Q12090 404 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GET4Q12125 312 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K COX17Q12287 69 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG34Q12292 412 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HTA2P04912 132 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ARG81P05085 880 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GPH1P06738 902 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HMG1P12683 1054 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SPS100P13130 326 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CBS2P14905 389 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPB5P20434 215 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GFD2P25370 566 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG15P25641 520 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC17P32602 292 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K TOD6P34219 525 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MDJ1P35191 511 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CAF4P36130 643 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR032WP38223 100 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.41□□□□□ -2.02not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SOK1P40317 901 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RIC1P40395 1056 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPE1P46969 238 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BPL1P48445 690 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K KEL2P50090 882 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K LYS5P50113 272 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN14P53196 417 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR079WP53249 370 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RCF2P53721 224 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K INN1P53901 409 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR460CP54007 376 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PFA5Q03289 374 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SEI1Q06058 285 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR446WQ06204 433 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 136.4 ms