RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR8Q05040 523 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SFH1Q06168 426 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SGT1Q08446 395 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ESA1Q08649 445 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MLH3Q12083 715 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YVC1Q12324 675 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SPE4Q12455 300 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF8Q12483 233 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PSF1Q12488 208 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J STT4P37297 1900 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPP2BP02400 110 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PRT1P06103 763 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO2P07269 559 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J UNG1P12887 359 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CTA1P15202 515 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK32P23060 363 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG9P29704 444 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AAR2P32357 355 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP150P32478 413 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J STE14P32584 239 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC61P32915 480 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DOA1P36037 715 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HSM3P38348 480 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TRR2P38816 342 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BZZ1P38822 633 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DLD3P39976 496 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ZRG8P40021 1076 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC26P41810 973 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SHR5P41912 237 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL043WP47053 257 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J APS3P47064 194 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MRM2P53123 320 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PBP1P53297 722 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BSC5P53755 489 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GOR1P53839 350 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J IDP3P53982 420 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YSA1Q01976 231 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC15Q02733 499 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR541CQ03049 344 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR210WQ03649 449 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GLO2Q05584 274 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR10Q06001 478 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS74Q06385 345 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA5Q06417 326 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR172WQ06608 200 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR091CQ06833 770 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YEH2Q07950 538 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR036CQ07986 203 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J FDH1Q08911 376 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J REX3Q12090 404 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GET4Q12125 312 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J COX17Q12287 69 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG34Q12292 412 aa2.42□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HTA2P04912 132 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG81P05085 880 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GPH1P06738 902 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HMG1P12683 1054 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SPS100P13130 326 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CBS2P14905 389 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB5P20434 215 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GFD2P25370 566 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG15P25641 520 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC17P32602 292 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TOD6P34219 525 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MDJ1P35191 511 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CAF4P36130 643 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR032WP38223 100 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.41□□□□□ -2.02not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J SOK1P40317 901 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RIC1P40395 1056 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPE1P46969 238 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BPL1P48445 690 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J KEL2P50090 882 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LYS5P50113 272 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN14P53196 417 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR079WP53249 370 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RCF2P53721 224 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J INN1P53901 409 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR460CP54007 376 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PFA5Q03289 374 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEI1Q06058 285 aa2.41□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR446WQ06204 433 aa2.41□□□□□ -2.02
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