RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	FAD1	P38913	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	LCB2	P40970	561 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SPG5	P42933	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	IMA2	Q08295	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SRL2	Q12020	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ATG34	Q12292	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	NAM9	P27929	486 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YBR137W	P38276	179 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YJL055W	P47044	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YGL242C	P53066	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	TRP1	P00912	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	GAT2	P40209	560 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	HER2	Q03557	464 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	URH1	Q04179	340 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	UAF30	Q08747	228 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PDE2	P06776	526 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
DSE3	YOR264W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MNE1	P24720	663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	YGR210C	P42942	411 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	SFH5	P47008	294 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	PIB2	P53191	635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	VPS9	P54787	451 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MMT1	Q03218	510 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	BCH1	Q05029	724 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	CDC21	P06785	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MDG1	P53885	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	STD1	Q02794	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	RUP1	Q12242	671 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	DST1	P07273	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	DAL2	P25335	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MNS1	P32906	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	YPS6	P40583	537 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	BRO1	P48582	844 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	TMS1	Q12116	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	YRM1	Q12340	786 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	PET123	P17558	318 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	CHK1	P38147	527 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	JLP2	P40206	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	REE1	P40893	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	YCL068C	P25593	260 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	INM1	P38710	295 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	STN1	P38960	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	EFM4	P40516	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	BTN2	P53286	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSE3	YOR264W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CYC3	P06182	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	ALG1	P16661	449 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	POP5	P28005	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MSG5	P38590	489 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	GPI16	P38875	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PAN6	P40459	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MTM1	P53320	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PHO91	P27514	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MDL1	P33310	695 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YOX1	P34161	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	ROG1	P53118	685 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CCE1	Q03702	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NDE2	Q07500	545 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RAX1	Q08760	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NCA2	Q12374	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NAM2	P11325	894 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CLN3	P13365	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	STP2	P38704	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	JEM1	P40358	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YIL029C	P40538	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CHS6	P40955	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	ERO1	Q03103	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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