RNA–Protein interactions for RNA: YNL218W

MGS1, Transcript of Protein with DNA-dependent ATPase and ssDNA annealing activities, yeast

Gene MGS1, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGS1	YNL218W	TAF14	P35189	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YHL026C	P38740	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SBE22	P38814	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	NVJ1	P38881	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RPH1	P39956	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SWM2	P40342	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MPM1	P40364	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	PAN6	P40459	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SKP2	P42843	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YNL260C	P53846	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	EMI1	Q04406	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	FEX2	Q08991	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MDM32	Q12171	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RTN2	Q12443	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	DST1	P07273	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RER1	P25560	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YPT7	P32939	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	ZRT3	P34240	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	UBX7	P38349	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RRG9	P40156	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	GTS1	P40956	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	AIM22	P47051	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	VPS25	P47142	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	ECM27	P47144	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MRH4	P53166	561 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YGR067C	P53243	804 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YNL165W	P53891	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YNL140C	P53910	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	VHS1	Q03785	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YML083C	Q04526	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	GPN3	Q06543	272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	GCN4	P03069	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SPS1	P08458	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	CSE2	P33308	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SDH3	P33421	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	TIP20	P33891	701 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	THI80	P35202	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	JEN1	P36035	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RSM22	P36056	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	DRE2	P36152	348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MRPL40	P36534	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SEA4	P38164	1038 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	COS111	P38308	924 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YBR225W	P38321	900 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YGR210C	P42942	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	ATG18	P43601	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	NNF1	P47149	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	NBP35	P52920	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MKC7	P53379	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RRN9	P53437	365 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	IGO1	P53897	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YNL143C	P53908	130 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MET31	Q03081	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	HEH2	Q03281	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	TRM8	Q12009	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	TGL5	Q12043	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	SIA1	Q12212	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LAA1	P39526	2014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	RBK1	P25332	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	PDR3	P33200	976 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LOT5	P34234	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MRPL3	P36516	390 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	YBR056W	P38081	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	TAT1	P38085	619 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	MCM7	P38132	845 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	APM3	P38153	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	PNT1	P38969	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
MGS1	YNL218W	EXO1	P39875	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	GDS1	P41913	522 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	LEM3	P42838	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MGS1	YNL218W	IRC7	P43623	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms