RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	VOA1	P53262	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	TAF12	Q03761	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ATC1	Q04005	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SWF1	Q04629	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RRG8	Q06109	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ARR1	Q06596	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	BSP1	Q06604	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RNH203	Q12338	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	LDB17	Q12342	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	CHD1	P32657	1468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SAC3	P46674	1301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RAD57	P25301	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MGR1	P25573	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PPZ1	P26570	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	KKQ8	P36004	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YHR122W	P38829	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PHO90	P39535	881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ATM1	P40416	690 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SNL1	P40548	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SNO3	P43544	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RHO4	Q00246	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ARP10	Q04549	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ECM7	Q06200	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	AAD15	Q08361	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	OPI3	P05375	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	DST1	P07273	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YCL068C	P25593	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SNC1	P31109	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YPS1	P32329	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	UTR4	P32626	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	NUP53	Q03790	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	URH1	Q04179	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	URC2	Q04411	772 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	APC4	Q04601	652 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SSK1	Q07084	712 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RKM5	Q12367	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MSK1	P32048	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SPT10	P35208	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YAL037W	P39728	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	FAU1	P40099	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PMT5	P52867	743 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	IMA2	Q08295	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	GLE1	Q12315	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	EDE1	P34216	1381 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	FRE1	P32791	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	BUD2	P33314	1104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
GTR1	YML121W	RTC2	P38279	296 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SCC4	P40090	624 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	TOS3	P43637	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	GPI1	P53306	609 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	DIC1	Q06143	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PFA4	Q12006	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RBD2	Q12270	262 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	QCR6	P00127	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CTR86	P25355	563 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YUR1	P26725	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PET100	P38958	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PCP1	P53259	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RET3	P53600	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	NUP100	Q02629	959 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SLD5	Q03406	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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