RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	YBR056W	P38081	501 aa		4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	YAL037W	P39728	267 aa		4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	HOT1	Q03213	719 aa		4.12	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	CYC3	P06182	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	CLB1	P24868	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	ISA2	Q12425	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	RAD57	P25301	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	POP5	P28005	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	MRPL10	P36520	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	ZIM17	P42844	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	RMT2	Q03305	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	BCH1	Q05029	724 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	MMR1	Q06324	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	MED2	Q12124	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	RBD2	Q12270	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	SLM4	P38247	162 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	RRT2	P38332	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	SFH5	P47008	294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	MHR1	Q06630	226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	SRL2	Q12020	392 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
OMA1	YKR087C	NAM2	P11325	894 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	JLP2	P40206	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	TIS11	P47977	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ATG34	Q12292	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MTR10	Q99189	972 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YHR131C	P38835	850 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	IRC25	Q07951	179 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YCL068C	P25593	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	KAR9	P32526	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	CHK1	P38147	527 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YIL029C	P40538	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MDE1	P47095	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	SHY1	P53266	389 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YLR152C	P54072	576 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ADA2	Q02336	434 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	CCE1	Q03702	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	AIM32	Q04689	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	NDE2	Q07500	545 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	FDH1	Q08911	376 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	AEP3	Q12089	606 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	CPR2	P23285	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	CSE2	P33308	149 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	TCB2	P48231	1178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MTQ1	P53944	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	URH1	Q04179	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	IMA2	Q08295	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	HEL1	P36113	551 aa		4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	SER3	P40054	469 aa		4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	STD1	Q02794	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	COX3	P00420	269 aa		4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	VHS2	P40463	436 aa		4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MMT1	Q03218	510 aa		4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.03	□□□□□ -1.76
OMA1	YKR087C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
OMA1	YKR087C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	SPR1	P32603	445 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	SBE22	P38814	852 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	COX14	P39103	70 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	BRO1	P48582	844 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	PIB2	P53191	635 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	RAX1	Q08760	435 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	HXT1	P32465	570 aa		4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	GAT2	P40209	560 aa		4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	YPS6	P40583	537 aa		4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	YGR111W	P53265	400 aa		4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	NCA2	Q12374	616 aa		4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	TOM22	P49334	152 aa		4	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	MRM2	P53123	320 aa		4	□□□□□ -1.77
OMA1	YKR087C	DCI1	Q08558	271 aa		4	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms