RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	SEC63	P14906	663 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SRB4	P32569	687 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	COT1	P32798	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YSW1	P38280	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SIP3	P38717	1229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SPC97	P38863	823 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YIL152W	P40455	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YRB2	P40517	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RET3	P53600	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	AQR1	P53943	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PPM1	Q04081	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	HSP31	Q04432	237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RRN11	Q04712	507 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	GEX1	P25596	615 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	BUB3	P26449	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RAD24	P32641	659 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	KKQ8	P36004	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MRPL37	P36532	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	VHS2	P40463	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YIR014W	P40570	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SAS2	P40963	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TOM22	P49334	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PGA2	P53903	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MSC3	Q05812	728 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	BOP2	Q06150	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SOR2	Q07786	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RAD61	Q99359	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	GLN3	P18494	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ATO2	P32907	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RFC3	P38629	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	BZZ1	P38822	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PET100	P38958	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MTW1	P39731	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	BNA5	Q05979	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SCEI	P03882	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CDC42	P19073	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	EXO70	P19658	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ITR1	P30605	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SUA5	P32579	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MSN4	P33749	630 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SSO2	P39926	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YTA12	P40341	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YFR018C	P43599	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PCP1	P53259	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	PRM1	P53835	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ECM7	Q06200	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SYO1	Q07395	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	SNA4	Q07549	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	LOT6	Q07923	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YEH2	Q07950	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RDS1	P25611	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	TRS65	P32893	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	YKR015C	P36111	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RRN10	P38204	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVJ1	YHR195W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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