RNA–Protein interactions for RNA: YFR008W

FAR7, Transcript of Protein involved in recovery from pheromone-induced cell cycle arrest, yeast

Gene FAR7, Length 666 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAR7	YFR008W	MHR1	Q06630	226 aa		2.61	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	CYC3	P06182	269 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	POP5	P28005	173 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	MRPL10	P36520	322 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RRT2	P38332	387 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	SHY1	P53266	389 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	BCH1	Q05029	724 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RBD2	Q12270	262 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RPC53	P25441	422 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	DBF4	P32325	704 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	YBR056W	P38081	501 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	JLP2	P40206	208 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	ZIM17	P42844	174 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	SFH5	P47008	294 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	TIS11	P47977	285 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	YLR152C	P54072	576 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	ADA2	Q02336	434 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	MMR1	Q06324	491 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	IRC25	Q07951	179 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	MED2	Q12124	431 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	ISA2	Q12425	185 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAR7	YFR008W	RAD57	P25301	460 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	HXT1	P32465	570 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	KAR9	P32526	644 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CSE2	P33308	149 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SLM4	P38247	162 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MDE1	P47095	244 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MTQ1	P53944	314 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	OCA2	P53949	197 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CCE1	Q03702	353 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	NDE2	Q07500	545 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SRL2	Q12020	392 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ATG34	Q12292	412 aa		2.58	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	NAM2	P11325	894 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CPR2	P23285	205 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CLB1	P24868	471 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YCL068C	P25593	260 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CHK1	P38147	527 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YHR131C	P38835	850 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YIL029C	P40538	142 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RMT2	Q03305	412 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	URH1	Q04179	340 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	FDH1	Q08911	376 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MTR10	Q99189	972 aa		2.57	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	BRO1	P48582	844 aa		2.56	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	STD1	Q02794	444 aa		2.56	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MMT1	Q03218	510 aa		2.56	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	AEP3	Q12089	606 aa		2.56	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	COX3	P00420	269 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SPR1	P32603	445 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SBE22	P38814	852 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	COX14	P39103	70 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	TCB2	P48231	1178 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	PIB2	P53191	635 aa		2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	IMA3	P0CW40	589 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	IMA4	P0CW41	589 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	UTH1	P36135	365 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	SER3	P40054	469 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	GAT2	P40209	560 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	VHS2	P40463	436 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YPS6	P40583	537 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MRM2	P53123	320 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	HAL1	Q01766	294 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	AIM32	Q04689	311 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	IMA2	Q08295	589 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	RAX1	Q08760	435 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	IZH2	Q12442	317 aa		2.54	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.53	□□□□□ -2	not detected
FAR7	YFR008W	PCL1	P24867	279 aa		2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	NUP2	P32499	720 aa		2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	HEL1	P36113	551 aa		2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
FAR7	YFR008W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2

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