RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	ATC1	Q04005	294 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	KEX2	P13134	814 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STE50	P25344	346 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BSD2	P38356	321 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AIM18	P38884	321 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CIN5	P40917	295 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNL033W	P53964	284 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNL019C	P53975	284 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ABF2	Q02486	183 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR160W	Q03823	816 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPM1	Q04081	328 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ECM11	Q04110	302 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HMX1	P32339	317 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PAH1	P32567	862 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SUV3	P32580	737 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AME1	P38313	324 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DOG2	P38773	246 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUG1	P40100	303 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RIM21	P48565	533 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NAS6	P50086	228 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RHO4	Q00246	291 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STE7	P06784	515 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUT2	P07275	575 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATP12	P22135	325 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ECM14	P38836	430 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAD55	P38953	406 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SAY1	P53324	424 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NGL3	Q03210	505 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HSP31	Q04432	237 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BDS1	Q08347	646 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NRT1	Q08485	598 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YIG1	Q08956	461 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DCN1	Q12395	269 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UFD4	P33202	1483 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPS2	P08459	502 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPO7	P18410	259 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YUR1	P26725	428 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TMN3	P40071	706 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR201C	P42936	225 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CTF3	Q12748	733 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDC9	P04819	755 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRT12	P25381	491 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPA2	P28239	310 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LYP1	P32487	611 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPG1	P32838	368 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YKL222C	P35995	705 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HMT1	P38074	348 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DUG2	P38149	878 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BMT2	P38278	337 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YHR131C	P38835	850 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NVJ1	P38881	321 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NET1	P47035	1189 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NUP53	Q03790	475 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ECM18	Q04623	453 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SLD7	Q08457	257 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LCB4	Q12246	624 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COA6	Q3E846	104 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AFI1	Q99222	893 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	URK1	P27515	501 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COQ8	P27697	501 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSK1	P32048	576 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DBF20	P32328	564 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BMT5	P40493	336 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CIN1	P40987	1014 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR017W	P53210	297 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAD59	Q12223	238 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FSH3	Q99369	266 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	POM152	P39685	1337 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TOP3	P13099	656 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
TOM1	YDR457W	UTR4	P32626	227 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALP1	P38971	573 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
TOM1	YDR457W	MSE1	P48525	536 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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