RNA–Protein interactions for RNA: YDR077W

SED1, Transcript of Major stress-induced structural GPI-cell wall glycoprotein, yeastyeast

Gene SED1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1YDR077W SCO2P38072 301 aa9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data9.03□□□□□ -0.96 RIP-Chip
SED1YDR077W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W LRO1P40345 661 aa9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W YML053CQ04978 212 aa9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W YPR022CQ12139 1133 aa9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W SFM1Q12314 213 aa9.03□□□□□ -0.96
SED1YDR077W PTP1P25044 335 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YCL049CP25577 312 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W LHS1P36016 881 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W ATG14P38270 344 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W EHT1P38295 451 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CEM1P39525 442 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YAR028WP39548 234 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W VRG4P40107 337 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MPM1P40364 252 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W LYS12P40495 371 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MRPS18P42847 217 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YNL181WP53878 407 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MSC1Q03104 513 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W APC4Q04601 652 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SPO77Q06134 477 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W DIN7Q12086 430 aa9.02□□□□□ -0.97
SED1YDR077W HTS1P07263 546 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W TAL1P15019 335 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CTR86P25355 563 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W AGP1P25376 633 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SAC1P32368 623 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CDC13P32797 924 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MRPL6P32904 214 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SEC61P32915 480 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SKN1P33336 771 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W NUF2P33895 451 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W OMA1P36163 345 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YBR285WP38354 144 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YHR177WP38867 453 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W QDR2P40474 542 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RAD30Q04049 632 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SWA2Q06677 668 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YOL107WQ12239 342 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YDR262WQ12331 272 aa9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MF(ALPHA)1P01149 165 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CDC4P07834 779 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W GAL7P08431 366 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RER1P25560 188 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SRB5P32585 307 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SFA1P32771 386 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SUI1P32911 108 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W DOA1P36037 715 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W FMP46P36141 133 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W AIM2P39721 246 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W TPA1P40032 644 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W FAU1P40099 211 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YJL068CP40363 299 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CIS3P47001 227 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RRN11Q04712 507 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W GLE1Q12315 538 aa9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SED1YDR077W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W CNA1P23287 553 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MGR1P25573 417 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W PRO1P32264 428 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W NTH1P32356 751 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MKK1P32490 508 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W ECM8P38246 354 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MSS2P40990 351 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YGR201CP42936 225 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W ESF2P53743 316 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W SWP1Q02795 286 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YML096WQ04489 525 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W GLO4Q12320 285 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MHF1Q3E835 90 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W TSC13Q99190 310 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RIB3Q99258 208 aa8.99□□□□□ -0.97
SED1YDR077W VPS33P20795 691 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W LHP1P33399 275 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W LOT5P34234 306 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W OAR1P35731 278 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YBR138CP38277 524 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YFL066CP43538 392 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W HOC1P47124 396 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RHO4Q00246 291 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YPL107WQ02873 248 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W IRC13Q08630 104 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W MRX4Q12467 430 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa8.98□□□□□ -0.97
SED1YDR077W NPR1P22211 790 aa8.97□□□□□ -0.97
SED1YDR077W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SED1YDR077W TEF4P36008 412 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SED1YDR077W YKR015CP36111 568 aa8.97□□□□□ -0.97
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