RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	GTO1	P48239	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	BUD32	P53323	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	VAC14	Q06708	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	MCH4	Q08268	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	BUG1	Q12191	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	BI2	P03873	423 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	CDC21	P06785	304 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	MAS1	P10507	462 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	MAK32	P23060	363 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	OCT1	P35999	772 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	YGL242C	P53066	181 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	MND1	P53102	219 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	VOA1	P53262	265 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	YNL146W	P53906	100 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	ATC1	Q04005	294 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	RRG8	Q06109	277 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	RDR1	Q08904	546 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	LDB17	Q12342	491 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LCB2	YDR062W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	HXT2	P23585	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RTT107	P38850	1070 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YHR177W	P38867	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ALP1	P38971	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ATM1	P40416	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YIL060W	P40519	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YPS6	P40583	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ORC5	P50874	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YGL185C	P53100	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RTT102	P53330	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PDR8	Q06149	701 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	NUP192	P47054	1683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RGT1	P32862	1170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	KKQ8	P36004	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SPG5	P42933	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YJL043W	P47053	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MUK1	Q02866	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RMD5	Q12508	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	CHS1	P08004	1131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YCL068C	P25593	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RAD24	P32641	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	LAG1	P38703	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	STP2	P38704	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GIS1	Q03833	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PIG1	Q06216	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	AAD15	Q08361	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RAD57	P25301	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GSY2	P27472	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	THI80	P35202	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YHR122W	P38829	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PET100	P38958	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	DSL1	P53847	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	TAF12	Q03761	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ARR1	Q06596	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RBD2	Q12270	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PDR11	P40550	1411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SUC2	P00724	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	BAR1	P12630	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SPT10	P35208	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	STV1	P37296	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SNL1	P40548	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PKP2	P53170	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	APC4	Q04601	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	BOP2	Q06150	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RNH203	Q12338	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MGR1	P25573	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	CTS1	P29029	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YPS1	P32329	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
LCB2	YDR062W	ARN1	P38731	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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