RNA–Protein interactions for RNA: YJL215C

YJL215C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL215C, Length 360 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL215C	YJL215C	CKI1	P20485	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SNT1	P25357	1226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GID7	P25569	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	CTM1	P38818	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YIL001W	P40560	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	IAH1	P41734	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ALT2	P52892	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	BUD32	P53323	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SEC5	P89102	971 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	RHO4	Q00246	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	NUP100	Q02629	959 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GRX3	Q03835	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GSH2	Q08220	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ATX2	Q12067	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	VPS54	Q12071	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MED2	Q12124	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	HIP1	P06775	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	TYR1	P20049	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	PSO2	P30620	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GYP6	P32806	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	REC114	P32841	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MSN2	P33748	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	CBP4	P37267	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YPK3	P38070	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	DUG2	P38149	878 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SLM4	P38247	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	POP1	P41812	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	CUL3	P53202	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	PEX25	Q02969	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	EKI1	Q03764	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SPC24	Q04477	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	THI7	Q05998	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	DCI1	Q08558	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ARP6	Q12509	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	PDR3	P33200	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	PHD1	P36093	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	THI2	P38141	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MMS4	P38257	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	VHC1	P38329	1120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SIP3	P38717	1229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	XBP1	P40489	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YIL089W	P40500	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	EFM4	P40516	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YGR117C	P53270	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	BET4	Q00618	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ADA2	Q02336	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	IZH1	Q03419	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	FAR8	Q05040	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GLO2	Q05584	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	NDL1	Q06568	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	AFT2	Q08957	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	TAF10	Q12030	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	URA4	P20051	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	BRF1	P29056	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ERG7	P38604	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YHR054C	P38780	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ATF1	P40353	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	EPL1	P43572	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SMA1	Q02651	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ACL4	Q03771	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	INP2	Q03824	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ARO80	Q04052	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	VAM3	Q12241	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	MYO1	P08964	1928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YPR089W	O13585	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	BAR1	P12630	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	ATP10	P18496	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	NUF2	P33895	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	YET1	P35723	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YJL215C	YJL215C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	RTS2	P40962	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	FET5	P43561	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL215C	YJL215C	PIB2	P53191	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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