RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	RPE1	P46969	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NMD5	P46970	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YGL185C	P53100	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MTQ1	P53944	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CRR1	Q05790	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	OPT2	Q06593	877 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	BSC6	Q08280	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FRE3	Q08905	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	APC9	Q12107	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DCS2	Q12123	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
MSC7	YHR039C	CTF3	Q12748	733 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PSK1	P31374	1356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
MSC7	YHR039C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SWI5	P08153	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NUC1	P08466	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YER152C	P10356	443 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SNF3	P10870	884 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TOP3	P13099	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HXT2	P23585	541 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DCC1	P25559	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YCR051W	P25631	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YCR061W	P25639	631 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PCL2	P25693	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PEP3	P27801	918 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	OAF3	P36023	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	VBA5	P36172	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SLI15	P38283	698 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SFB3	P38810	929 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RBG1	P39729	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	BUR6	P40096	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SET4	P42948	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ALR2	P43553	858 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YAR1	P46683	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HIT1	P46973	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YJR149W	P47177	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RTT102	P53330	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YIP3	P53633	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YNL143C	P53908	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	OST6	Q03723	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	GPM2	Q12008	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NSL1	Q12143	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ATG34	Q12292	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	INO1	P11986	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	URA6	P15700	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	UGA1	P17649	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ERV1	P27882	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PPA2	P28239	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PMT2	P31382	759 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SEF1	P34228	1148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DOA1	P36037	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DUG2	P38149	878 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FMP23	P38231	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AKR1	P39010	764 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PUG1	P40100	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DOT5	P40553	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TOS3	P43637	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FMP33	P46998	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	EFM3	P47163	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	COG1	P53079	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	IMO32	P53219	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RIM13	Q03792	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CSN9	Q03981	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AIM33	Q04516	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SNO4	Q04902	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	STE23	Q06010	1027 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CRT10	Q08226	957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TRE1	Q08919	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HSP32	Q08992	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ATG31	Q12421	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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