RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	MMS21	P38632	267 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RPP1	P38786	293 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RTT107	P38850	1070 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SPC97	P38863	823 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	FET3	P38993	636 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YEL020C	P39994	560 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PIG2	P40187	538 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	HXT9	P40885	567 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	FMP33	P46998	180 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	LOH1	P47055	219 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	NPA3	P47122	385 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SAM50	P53969	484 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	HXT11	P54862	567 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SPP2	Q02521	185 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	POS5	Q06892	414 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CYK3	Q07533	885 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TEN1	Q07921	160 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ATG9	Q12142	997 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SEC63	P14906	663 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CBF1	P17106	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ZRC1	P20107	442 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RHB1	P25378	209 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	KRE2	P27809	442 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RPC34	P32910	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	LHS1	P36016	881 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	AIM29	P36154	155 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	QDR3	P38227	689 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PTC7	P38797	343 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YHR177W	P38867	453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	UIP3	P39547	235 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ECM10	P39987	644 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PCL6	P40038	420 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SNL1	P40548	159 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	OPT1	P40897	799 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SAD1	P43589	448 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YFR020W	P43600	232 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ATG27	P46989	271 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	MSY1	P48527	492 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	MRPS35	P53292	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
SLX8	YER116C	CDD1	Q06549	142 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GRS2	Q06817	618 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TPO1	Q07824	586 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PAM18	Q07914	168 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RAX1	Q08760	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TIP41	Q12199	356 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	UBA3	Q99344	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	ABF1	P14164	731 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	UTR1	P21373	530 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CNE1	P27825	502 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	RSM22	P36056	628 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GMH1	P36125	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	LDB7	P38210	180 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	DSE1	P40077	573 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SPG5	P42933	373 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GLG2	P47011	380 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	STE24	P47154	453 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	MIG2	P53035	382 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YNL181W	P53878	407 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SHR3	Q02774	210 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	MRP51	Q02950	344 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	VPS74	Q06385	345 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SYO1	Q07395	620 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SHS1	Q07657	551 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.87	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms