RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 MYH4Q9Y623 1939 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NCK2O43639 380 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NOL4O94818 638 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ERCC3P19447 782 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PICALMQ13492 652 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 CAVIN3Q969G5 261 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SWAP70Q9UH65 585 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SH3GL2Q99962 352 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB5O15062 677 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 BUB1O43683 1085 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 OPA1O60313 960 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TLR2O60603 784 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NNTQ13423 1086 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 BBOX1O75936 387 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SLC7A5Q01650 507 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PPFIA1Q13136 1202 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ALS2CLQ60I27 953 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 EHD2Q9NZN4 543 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ADRA2BP18089 450 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 NAB2Q15742 525 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SLC18A3Q16572 532 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GBP6Q6ZN66 633 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 POLLQ9UGP5 575 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM66O15016 1216 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 CLSTN1O94985 981 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 PLA2G4BP0C869 781 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 GPBP1Q86WP2 473 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 IFT20Q8IY31 132 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 RUFY1Q96T51 708 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 HINFPQ9BQA5 517 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-201ENST00000355530 E9PMD0 336 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 HSF2BPO75031 334 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 PALMO75781 387 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 EPS15P42566 896 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
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SPNS3-201ENST00000355530 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 GJA10Q969M2 543 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 C8orf37Q96NL8 207 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 USP17L10C9JJH3 530 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 GTF2IP78347 998 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 TMC4Q7Z404 712 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D5Q92609 795 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 NGLY1Q96IV0 654 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 GANQ9H2C0 597 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 GDF3Q9NR23 364 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 POTEB3A0JP26 581 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 POTECB2RU33 542 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 C6orf229H3BNL8 230 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-201ENST00000355530 CYP11B2P19099 503 aa20.06■□□□□ 0.8
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