RNA–Protein interactions for RNA: YPR017C

DSS4, Transcript of Guanine nucleotide dissociation stimulator for Sec4p, yeast

Gene DSS4, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS4	YPR017C	INH1	P01097	85 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	NMT1	P14743	455 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	MSH1	P25846	959 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SFP1	P32432	683 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SPR1	P32603	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SKT5	P34226	696 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	WSC4	P38739	605 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	CIN4	P39110	191 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	MEP1	P40260	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	AIF1	P52923	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	CLD1	P53264	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	IBD2	P53892	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	UBX4	P54730	416 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TAF12	Q03761	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SEC10	Q06245	871 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	GRS2	Q06817	618 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
DSS4	YPR017C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	NTG2	Q08214	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TRM8	Q12009	286 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	HEM2	P05373	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	RHO2	P06781	192 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	RSR1	P13856	272 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YSR3	P23501	404 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	CIN8	P27895	1000 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TFB1	P32776	642 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PTM1	P32857	523 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YKL100C	P34248	587 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	RIM2	P38127	377 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	MUM2	P38236	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YHR045W	P38775	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	MGS1	P40151	587 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SHY1	P53266	389 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	ATG4	P53867	494 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	RMI1	Q02685	241 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YML119W	Q03208	357 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	GOT1	Q03554	138 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TRM12	Q04235	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PLB3	Q08108	686 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SEC15	P22224	910 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	VPS34	P22543	875 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PCL2	P25693	308 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	ATP11	P32453	318 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	MRE11	P32829	692 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PTH2	P34222	208 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	NUP120	P35729	1037 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YBR062C	P38239	180 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	UBA4	P38820	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	PRM2	P40534	656 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TDA10	P42938	290 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	GAT1	P43574	510 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TIS11	P47977	285 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TAF6	P53040	516 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SWS2	P53937	143 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TRM82	Q03774	444 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	TVP15	Q03860	143 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	BCH1	Q05029	724 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	ATG33	Q06485	197 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	APC9	Q12107	265 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	RPN13	O13563	156 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	PHO5	P00635	467 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	CDC21	P06785	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	MET8	P15807	274 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	CLB1	P24868	471 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	COX13	P32799	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	RRN3	P36070	627 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	MRPL37	P36532	105 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DSS4	YPR017C	HSM3	P38348	480 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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