RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	PRP28	P23394	588 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	POL4	P25615	582 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GAC1	P28006	793 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	BRF1	P29056	596 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MCM10	P32354	571 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NTH1	P32356	751 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ATO2	P32907	282 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NUF2	P33895	451 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FRE2	P36033	711 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SKG1	P36169	355 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YBR053C	P38235	358 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FTH1	P38310	465 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ATM1	P40416	690 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MSS2	P40990	351 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MAF1	P41910	395 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	KTR6	P54070	446 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CSN9	Q03981	162 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NDL1	Q06568	189 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ULA1	Q12059	462 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	LAS17	Q12446	633 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VCX1	Q99385	411 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MSS51	P32335	436 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TFB1	P32776	642 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RGT1	P32862	1170 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	PTC1	P35182	281 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ASK1	P35734	292 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TPO5	P36029	618 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CDS1	P38221	457 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TDP1	P38319	544 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	PEX18	P38855	283 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	UME6	P39001	836 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SEO1	P39709	593 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MNT3	P40549	630 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YFL040W	P43562	540 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SAP4	P53036	818 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RMR1	P53060	241 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YNL095C	P53932	642 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YNL033W	P53964	284 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YNL019C	P53975	284 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MMT1	Q03218	510 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	KRE28	Q04431	385 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	AIM32	Q04689	311 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	LOT6	Q07923	191 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MDY2	Q12285	212 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SAS5	Q99314	248 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TAO3	P40468	2376 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	REP1	P03871	373 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TPK1	P06244	397 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MAS2	P11914	482 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RAP1	P11938	827 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DMC1	P25453	334 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DCG1	P32460	244 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MRPL7	P36519	292 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MRP21	P38175	177 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	EHT1	P38295	451 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HAT2	P39984	401 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YEL028W	P39989	153 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	COA1	P40452	197 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RTT101	P47050	842 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YDL183C	P48569	320 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SCS3	P53012	380 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ORM1	P53224	222 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GTR2	P53290	341 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ACS1	Q01574	713 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	INA17	Q02888	182 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GAS3	Q03655	524 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GPI17	Q04080	534 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YDR109C	Q04585	715 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HER1	Q12276	1246 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YPL247C	Q12523	523 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HEM2	P05373	342 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	POX1	P13711	748 aa		5.49	□□□□□ -1.53

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