RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	YFH1	Q07540	174 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	RRT8	Q08219	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	GAC1	P28006	793 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	MIC60	P36112	540 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	TSC10	P38342	320 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	ANS1	P38832	159 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	LAS21	P40367	830 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	PMT6	P42934	759 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	YGL108C	P53139	140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	ECM18	Q04623	453 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	HRD3	Q05787	833 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	NDJ1	Q12366	352 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	VPS63	O13549	108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	SPS4	P09937	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	RAD14	P28519	371 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	MSG5	P38590	489 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	VAB2	P40003	282 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	NDC80	P40460	691 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	ASG1	P40467	964 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	ATG27	P46989	271 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	STB4	P50104	949 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	CYK3	Q07533	885 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	GSH2	Q08220	491 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	MTR10	Q99189	972 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	RAD61	Q99359	647 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	MYO1	P08964	1928 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATR1	YML116W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PDE2	P06776	526 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	CHO1	P08456	276 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	GEX1	P25596	615 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YUH1	P35127	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MMS4	P38257	691 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YFR018C	P43599	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	NUP84	P52891	726 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MPS2	P53159	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	WAR1	Q03631	944 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	CUR1	Q06469	252 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	COR1	P07256	457 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	COQ1	P18900	473 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	BEM1	P29366	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	NDI1	P32340	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	CIN4	P39110	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YPR003C	P53394	754 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PRM1	P53835	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ACF2	Q12168	779 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	SUT2	Q12286	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	COX3	P00420	269 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PCA1	P38360	1216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	DBP8	P38719	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PIH1	P38768	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ARG2	P40360	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	NMD5	P46970	1048 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	SLG1	P54867	378 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	SMA2	Q04658	369 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ARO10	Q06408	635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YLR413W	Q06689	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	APC5	Q08683	685 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	RRD2	Q12461	358 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PUT2	P07275	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	SAG1	P20840	650 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	PTC6	P25646	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	YBR139W	P38109	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	HSM3	P38348	480 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MBB1	P39534	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	CIN1	P40987	1014 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	RSM23	Q01163	450 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	MED2	Q12124	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATR1	YML116W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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