RNA–Protein interactions for RNA: YML093W

UTP14, Transcript of Subunit of U3-containing Small Subunit (SSU) processome complex, yeast

Gene UTP14, Length 2,700 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP14	YML093W	GRE1	Q08969	168 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SEC12	P11655	471 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SNA3	P14359	133 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CDC26	P14724	124 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	STE18	P18852	110 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	URA4	P20051	364 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CWP1	P28319	239 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	VPH2	P32341	215 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RPD3	P32561	433 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NNK1	P36003	928 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	AIM29	P36154	155 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	AME1	P38313	324 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MMS21	P38632	267 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	ATM1	P40416	690 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MAD2	P40958	196 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	BUD8	P41698	603 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	BIT61	P47041	543 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YGR149W	P48236	432 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YPT11	P48559	417 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YIP5	P53108	310 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YNR071C	P53757	342 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	GOR1	P53839	350 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
UTP14	YML093W	BOP3	P53958	396 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	VPS60	Q03390	229 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	APC4	Q04601	652 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YDR222W	Q04925	415 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	DYN3	Q04949	312 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YPR196W	Q06595	470 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SMC5	Q08204	1093 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	UPC2	Q12151	913 aa		2.61	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PET122	P10355	254 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	REV1	P12689	985 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YCL002C	P25565	263 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	GSY2	P27472	705 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NAM9	P27929	486 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
UTP14	YML093W	TUL1	P36096	758 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	TDP1	P38319	544 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	RIP-Chip
UTP14	YML093W	SEO1	P39709	593 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RPH1	P39956	796 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NPP2	P39997	493 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	VAB2	P40003	282 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	ELO3	P40319	345 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SMA2	Q04658	369 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	COX20	Q04935	205 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YLR407W	Q06070	228 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SGO1	Q08490	590 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	TMA16	Q08687	178 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MUM3	Q08750	479 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RDR1	Q08904	546 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	AKR2	Q12013	749 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PER33	Q12144	273 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YPT6	Q99260	215 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RAD50	P12753	1312 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SOD2	P00447	233 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PRO1	P32264	428 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RAD24	P32641	659 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	MLH1	P38920	769 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NUP60	P39705	539 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	YEL020C	P39994	560 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	SER3	P40054	469 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	JLP2	P40206	208 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	PCI8	P40512	444 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	TAH11	P47112	604 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CCC1	P47818	322 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	DIA3	P52290	468 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	CTF19	Q02732	369 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	UBP16	Q02863	499 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	TAF12	Q03761	539 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	FIN1	Q03898	291 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	RKM2	Q03942	479 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	BCH1	Q05029	724 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UTP14	YML093W	DCS1	Q06151	350 aa		2.6	□□□□□ -1.99

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